More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3639 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  89.54 
 
 		 700 aa  1133    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  60.64 
 
 		 758 aa  832    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  59.86 
 
 		 758 aa  815    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 703 aa  1423    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  48.14 
 
 		 721 aa  609  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  49.56 
 
 		 801 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  48.59 
 
 		 808 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.11 
 
 		 766 aa  581  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  47.03 
 
 		 710 aa  568  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  47.31 
 
 		 710 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.2 
 
 		 705 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  40.12 
 
 		 773 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  39.65 
 
 		 801 aa  385  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  38.1 
 
 		 789 aa  365  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  39.1 
 
 		 871 aa  365  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 		 819 aa  364  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  38.96 
 
 		 880 aa  361  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  36.71 
 
 		 739 aa  360  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.19 
 
 		 737 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  36.81 
 
 		 744 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  39.1 
 
 		 892 aa  353  7e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  37.64 
 
 		 807 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  39 
 
 		 1057 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 		 820 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  38.34 
 
 		 726 aa  334  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.26 
 
 		 736 aa  329  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  34.64 
 
 		 784 aa  325  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  33.64 
 
 		 740 aa  323  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 		 759 aa  320  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  35.23 
 
 		 830 aa  317  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  37.08 
 
 		 877 aa  316  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.75 
 
 		 695 aa  316  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.39 
 
 		 747 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  35.19 
 
 		 821 aa  313  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  36.09 
 
 		 833 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  35.99 
 
 		 680 aa  300  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  36.5 
 
 		 814 aa  294  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.57 
 
 		 763 aa  289  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  33.69 
 
 		 771 aa  283  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 		 824 aa  281  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  31.59 
 
 		 772 aa  281  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 		 840 aa  279  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 818 aa  279  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  32.79 
 
 		 727 aa  278  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 766 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  35.67 
 
 		 828 aa  277  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.12 
 
 		 720 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 816 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 816 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 816 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 		 817 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  34.27 
 
 		 693 aa  274  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  33.38 
 
 		 723 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  31.48 
 
 		 768 aa  273  6e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  35.03 
 
 		 807 aa  273  9e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  34.88 
 
 		 810 aa  273  9e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 830 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  35.45 
 
 		 765 aa  271  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  30.9 
 
 		 773 aa  270  8e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 		 831 aa  270  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 		 831 aa  270  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.8 
 
 		 761 aa  268  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.92 
 
 		 821 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.98 
 
 		 817 aa  268  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.09 
 
 		 727 aa  264  4.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  32.84 
 
 		 838 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  32.55 
 
 		 750 aa  259  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 		 816 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  33.84 
 
 		 710 aa  256  9e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  32.66 
 
 		 722 aa  248  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  32.26 
 
 		 905 aa  247  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  30.14 
 
 		 683 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  29.52 
 
 		 683 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  30.14 
 
 		 683 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  29.57 
 
 		 683 aa  245  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  29.68 
 
 		 683 aa  245  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  30.19 
 
 		 683 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  29.88 
 
 		 683 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  29.68 
 
 		 683 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.05 
 
 		 859 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 683 aa  242  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  28.29 
 
 		 806 aa  240  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  30.92 
 
 		 723 aa  239  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  29.94 
 
 		 683 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  31 
 
 		 681 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.37 
 
 		 761 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  33.11 
 
 		 658 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  29.75 
 
 		 648 aa  233  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  30.95 
 
 		 640 aa  231  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 695 aa  231  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  29.58 
 
 		 661 aa  230  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.67 
 
 		 761 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  33.33 
 
 		 764 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  27.57 
 
 		 648 aa  223  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  30.71 
 
 		 625 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.69 
 
 		 618 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  29.27 
 
 		 683 aa  219  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  31.36 
 
 		 765 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.35 
 
 		 643 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>