More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5853 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 819 aa  1653    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  70.38 
 
 		 880 aa  995    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  46.81 
 
 		 871 aa  592  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  44.78 
 
 		 877 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  44.82 
 
 		 773 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  42.4 
 
 		 801 aa  484  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  43.08 
 
 		 789 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  38.87 
 
 		 892 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  39.8 
 
 		 744 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  41.7 
 
 		 740 aa  459  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  41.12 
 
 		 1057 aa  450  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  42.06 
 
 		 820 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  40.54 
 
 		 739 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.02 
 
 		 747 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.68 
 
 		 737 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.17 
 
 		 759 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.27 
 
 		 736 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  35.71 
 
 		 784 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  39.01 
 
 		 807 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  39.64 
 
 		 726 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.33 
 
 		 766 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.99 
 
 		 705 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  39.7 
 
 		 758 aa  382  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 758 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  37.85 
 
 		 801 aa  376  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  38.65 
 
 		 814 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  37.83 
 
 		 821 aa  376  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  35.25 
 
 		 833 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  36.84 
 
 		 721 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.47 
 
 		 763 aa  369  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.23 
 
 		 695 aa  364  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  39.34 
 
 		 680 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  34.53 
 
 		 727 aa  360  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  34.32 
 
 		 772 aa  359  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.02 
 
 		 821 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 		 808 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  35.58 
 
 		 761 aa  344  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 		 766 aa  340  9e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  34.78 
 
 		 771 aa  339  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  36.17 
 
 		 807 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.14 
 
 		 817 aa  337  5.999999999999999e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.46 
 
 		 720 aa  334  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 723 aa  333  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 		 710 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  34.59 
 
 		 765 aa  328  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 710 aa  323  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 		 816 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 816 aa  321  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 816 aa  321  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 		 828 aa  321  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  35.88 
 
 		 722 aa  317  8e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  34.78 
 
 		 723 aa  315  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 		 817 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 		 695 aa  313  9e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 		 818 aa  312  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  35.57 
 
 		 838 aa  311  4e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  32.25 
 
 		 830 aa  310  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 		 703 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 		 830 aa  307  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 		 831 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 		 831 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.66 
 
 		 840 aa  305  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  37.95 
 
 		 700 aa  305  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  34.88 
 
 		 810 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 1245 aa  302  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 		 824 aa  300  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  33.28 
 
 		 905 aa  298  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.02 
 
 		 727 aa  297  5e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.02 
 
 		 816 aa  295  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  34.38 
 
 		 648 aa  294  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  33.18 
 
 		 643 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  33.18 
 
 		 643 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  31.78 
 
 		 806 aa  288  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  35.1 
 
 		 811 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  33.85 
 
 		 693 aa  282  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  30.94 
 
 		 776 aa  280  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.12 
 
 		 727 aa  279  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  33.39 
 
 		 710 aa  278  3e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  30.58 
 
 		 773 aa  274  6e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  33.49 
 
 		 734 aa  273  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  34.39 
 
 		 726 aa  273  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  33.97 
 
 		 750 aa  272  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  30.74 
 
 		 768 aa  272  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  31.99 
 
 		 643 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  34.14 
 
 		 712 aa  271  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  32.92 
 
 		 765 aa  271  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  33.76 
 
 		 732 aa  270  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.24 
 
 		 761 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  32.74 
 
 		 656 aa  270  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  33 
 
 		 649 aa  270  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  31.29 
 
 		 833 aa  268  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  34.05 
 
 		 723 aa  267  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  33.06 
 
 		 755 aa  267  7e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  32.09 
 
 		 817 aa  266  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 		 1065 aa  266  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  33.76 
 
 		 658 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  33.93 
 
 		 720 aa  266  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  32.45 
 
 		 704 aa  265  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  32.91 
 
 		 735 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.87 
 
 		 890 aa  261  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>