More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26280 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 
821 aa  1696    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  43.75 
 
 
784 aa  574  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  41.69 
 
 
833 aa  539  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  42.25 
 
 
838 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  42.2 
 
 
765 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  41.5 
 
 
763 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  41.58 
 
 
807 aa  498  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  39.25 
 
 
821 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  38.01 
 
 
772 aa  446  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  36.63 
 
 
768 aa  440  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.29 
 
 
727 aa  440  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  36.98 
 
 
773 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  36.28 
 
 
727 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  36.99 
 
 
801 aa  416  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
723 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 
820 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
766 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  35.58 
 
 
773 aa  400  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  35.77 
 
 
789 aa  396  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 
807 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  36.53 
 
 
892 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  34.76 
 
 
740 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  36.23 
 
 
880 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 
871 aa  363  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 
819 aa  358  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.34 
 
 
817 aa  353  5e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  35.26 
 
 
877 aa  351  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  34.46 
 
 
739 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  35.53 
 
 
726 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  34.13 
 
 
744 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  30.6 
 
 
830 aa  324  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.4 
 
 
747 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.54 
 
 
737 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.29 
 
 
736 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.25 
 
 
695 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  32.24 
 
 
721 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  32.53 
 
 
814 aa  301  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  35 
 
 
1057 aa  301  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
758 aa  299  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 
758 aa  299  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.52 
 
 
759 aa  295  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  32.37 
 
 
693 aa  294  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  30.35 
 
 
771 aa  292  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.87 
 
 
720 aa  292  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
801 aa  290  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.94 
 
 
705 aa  288  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
808 aa  283  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  33.03 
 
 
761 aa  279  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
818 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  33.18 
 
 
680 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
817 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 
766 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  31.23 
 
 
836 aa  266  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  30.43 
 
 
750 aa  264  4.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.61 
 
 
840 aa  263  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
828 aa  263  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 
816 aa  262  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
830 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
816 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
816 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
816 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  29.1 
 
 
810 aa  258  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
831 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
831 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
710 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  29.12 
 
 
723 aa  253  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
710 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  31.51 
 
 
806 aa  250  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  30.38 
 
 
722 aa  250  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.76 
 
 
761 aa  249  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
824 aa  248  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  31.78 
 
 
726 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
700 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  30.59 
 
 
710 aa  243  7.999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  28.13 
 
 
626 aa  237  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  28.03 
 
 
640 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  28.71 
 
 
829 aa  234  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  28.69 
 
 
658 aa  234  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
778 aa  233  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
1065 aa  231  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  28.77 
 
 
640 aa  232  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  29.2 
 
 
668 aa  230  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  30.24 
 
 
710 aa  228  3e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  28.32 
 
 
661 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  30.08 
 
 
712 aa  226  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  28.55 
 
 
734 aa  224  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
703 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.25 
 
 
890 aa  224  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  29.23 
 
 
905 aa  223  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  29.5 
 
 
618 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  27.13 
 
 
648 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  28.96 
 
 
741 aa  222  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  29.48 
 
 
811 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  29.05 
 
 
765 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  28.44 
 
 
751 aa  221  5e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  29.69 
 
 
817 aa  220  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  28.44 
 
 
776 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  29.12 
 
 
708 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  29.3 
 
 
712 aa  218  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  28.36 
 
 
648 aa  218  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>