More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0345 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0345  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 987 aa  2023    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0145524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  33.66 
 
 		 752 aa  299  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 		 1245 aa  281  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  32.5 
 
 		 822 aa  278  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 778 aa  277  8e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 695 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  29.81 
 
 		 808 aa  270  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 		 764 aa  269  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 		 747 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  31.83 
 
 		 719 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.74 
 
 		 1129 aa  263  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  30.97 
 
 		 825 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  32.12 
 
 		 1306 aa  254  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  30.92 
 
 		 1117 aa  253  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  29.6 
 
 		 836 aa  246  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.02 
 
 		 761 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 		 867 aa  239  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.08 
 
 		 890 aa  238  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 1065 aa  238  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  30.83 
 
 		 764 aa  234  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.3 
 
 		 859 aa  229  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  29.57 
 
 		 803 aa  229  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  30.33 
 
 		 724 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  29.17 
 
 		 761 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.64 
 
 		 725 aa  213  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  29.34 
 
 		 661 aa  213  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  26.22 
 
 		 978 aa  212  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  29.55 
 
 		 776 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  28.86 
 
 		 714 aa  207  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  29.09 
 
 		 714 aa  206  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 806 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 806 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 806 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  27.16 
 
 		 770 aa  204  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 975 aa  203  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  28.83 
 
 		 833 aa  202  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  28.15 
 
 		 727 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  27.75 
 
 		 727 aa  201  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  29.4 
 
 		 648 aa  201  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  28.15 
 
 		 727 aa  201  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  29.32 
 
 		 821 aa  200  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  25.8 
 
 		 796 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  27.03 
 
 		 774 aa  200  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  28.06 
 
 		 765 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  27.68 
 
 		 712 aa  199  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  28.34 
 
 		 961 aa  198  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  26.91 
 
 		 730 aa  197  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  27.74 
 
 		 728 aa  197  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  27.79 
 
 		 720 aa  196  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  28.49 
 
 		 739 aa  197  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  29.07 
 
 		 683 aa  196  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  29.07 
 
 		 683 aa  196  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  28.74 
 
 		 683 aa  196  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  29.32 
 
 		 720 aa  196  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  27.71 
 
 		 763 aa  195  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  27.71 
 
 		 730 aa  195  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  27.46 
 
 		 728 aa  194  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  27.8 
 
 		 795 aa  194  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  27.55 
 
 		 806 aa  194  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 979 aa  194  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  28.72 
 
 		 683 aa  194  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  28.39 
 
 		 683 aa  193  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  28.55 
 
 		 683 aa  193  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  28.57 
 
 		 683 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  27.15 
 
 		 732 aa  193  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  28.96 
 
 		 732 aa  191  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  28.31 
 
 		 784 aa  191  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  27.95 
 
 		 735 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  28.48 
 
 		 890 aa  190  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  28.99 
 
 		 649 aa  190  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  27.87 
 
 		 679 aa  189  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 		 769 aa  189  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  29.36 
 
 		 750 aa  189  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  28.82 
 
 		 741 aa  189  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  27.18 
 
 		 727 aa  189  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  28.4 
 
 		 654 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  26.82 
 
 		 838 aa  189  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  26.22 
 
 		 641 aa  188  5e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  27.66 
 
 		 755 aa  187  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  25.85 
 
 		 705 aa  187  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  26.85 
 
 		 905 aa  186  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  26.27 
 
 		 760 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  28.72 
 
 		 683 aa  186  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  26.57 
 
 		 710 aa  186  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  27.45 
 
 		 683 aa  185  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  27.69 
 
 		 752 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  27.86 
 
 		 618 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  28.23 
 
 		 734 aa  184  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  27.35 
 
 		 643 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  28.2 
 
 		 683 aa  184  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  27.16 
 
 		 713 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  27.16 
 
 		 713 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  27.21 
 
 		 625 aa  183  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  27.16 
 
 		 713 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  27.66 
 
 		 668 aa  183  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  27.18 
 
 		 713 aa  183  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  28.68 
 
 		 779 aa  183  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  28.66 
 
 		 801 aa  182  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  28.14 
 
 		 734 aa  182  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  27.06 
 
 		 655 aa  182  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>