85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2620 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2286  outer membrane adhesin like proteiin  86.74 
 
 
510 aa  888    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2620  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 
513 aa  1026    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6333  autoaggregation protein  50.85 
 
 
237 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2980  autoaggregation protein  52.61 
 
 
236 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3228  autoaggregation protein  53.48 
 
 
232 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4582  autoaggregation protein  50.85 
 
 
235 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.581198  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2314  putative fusion protein: autoaggregation protein and hypothetical conserved protein  55.81 
 
 
261 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.013447  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  32.51 
 
 
2555 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2238  autoaggregation protein (adhering protein)  38.52 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  29.54 
 
 
3508 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2017  autoaggregation protein (adhering protein)  43.33 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3480  outer membrane adhesin like proteiin  45.08 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.94 
 
 
1599 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  25.71 
 
 
3229 aa  67  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  34.54 
 
 
3714 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 
2524 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29.39 
 
 
4978 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  29.73 
 
 
3182 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.34 
 
 
1553 aa  60.1  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  29.84 
 
 
3758 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  27.43 
 
 
16322 aa  58.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  23.85 
 
 
3259 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  32.47 
 
 
7149 aa  57  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  30 
 
 
2812 aa  57  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  34.19 
 
 
2337 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3188  outer membrane adhesin like proteiin  37.19 
 
 
277 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.56 
 
 
4836 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  29.81 
 
 
4748 aa  56.6  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  32.61 
 
 
6779 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.61 
 
 
6683 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  29.44 
 
 
3191 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2256  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  41.41 
 
 
496 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.81 
 
 
2067 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.81 
 
 
3038 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  27.31 
 
 
5094 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  32.46 
 
 
6662 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  31.58 
 
 
5745 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  32.57 
 
 
2768 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  43.66 
 
 
4854 aa  52  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  30.85 
 
 
4791 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  43.53 
 
 
541 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.14 
 
 
5098 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  34.51 
 
 
1586 aa  51.2  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  28.75 
 
 
3544 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  27.83 
 
 
1215 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.21 
 
 
4122 aa  50.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  27.83 
 
 
1215 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  43.94 
 
 
3923 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 
1728 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  41.18 
 
 
537 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  25.97 
 
 
1883 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  36 
 
 
2887 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  29.81 
 
 
2784 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  30.72 
 
 
16311 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  29.5 
 
 
5442 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  30.17 
 
 
4285 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.91 
 
 
5839 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  29.18 
 
 
1215 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.18 
 
 
1215 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  32.56 
 
 
6678 aa  48.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  29.23 
 
 
3026 aa  48.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.15 
 
 
3816 aa  47.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2574  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  35.25 
 
 
497 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.053652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  28.63 
 
 
2816 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 
1215 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  30.8 
 
 
1268 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  26.23 
 
 
1706 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  27.13 
 
 
4848 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.85 
 
 
5787 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  33.06 
 
 
1806 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.66 
 
 
3552 aa  45.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  33.06 
 
 
1350 aa  45.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  35.53 
 
 
3824 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  27.92 
 
 
2522 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  24.89 
 
 
1597 aa  44.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  28.57 
 
 
3824 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  55.26 
 
 
6310 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  37.93 
 
 
3739 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  37.93 
 
 
3824 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  37.93 
 
 
3721 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  55.26 
 
 
8064 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  29.31 
 
 
2743 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.47 
 
 
2239 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  31.72 
 
 
1269 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  26.23 
 
 
5020 aa  43.5  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>