23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4158 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4158  hypothetical protein  100 
 
 
508 aa  1025    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0491983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05700  hypothetical protein  33.26 
 
 
514 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0732468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0628  hypothetical protein  32.67 
 
 
694 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6943  hypothetical protein  29.83 
 
 
602 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000267978  normal  0.67649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5086  hypothetical protein  26.76 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  42.86 
 
 
1236 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.54 
 
 
541 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  40.91 
 
 
1206 aa  73.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.3 
 
 
496 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  30.86 
 
 
495 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  30.93 
 
 
565 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1313  hypothetical protein  24.44 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  31.54 
 
 
537 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
547 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2850  hypothetical protein  37.23 
 
 
540 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000112945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2574  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.27 
 
 
497 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.053652  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2256  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.17 
 
 
496 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  41.25 
 
 
1302 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2973  PKD domain containing protein  36.84 
 
 
586 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2763  hypothetical protein  36.13 
 
 
1117 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.97 
 
 
428 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  36.13 
 
 
1117 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  31.73 
 
 
898 aa  43.9  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>