32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4923 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4923  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.366855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  32.61 
 
 		 763 aa  58.2  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  35.06 
 
 		 516 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  27.27 
 
 		 426 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  38.71 
 
 		 287 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  32.14 
 
 		 679 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  32 
 
 		 1162 aa  52  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  27.5 
 
 		 695 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  37.68 
 
 		 673 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  37.7 
 
 		 479 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  34.25 
 
 		 2324 aa  48.9  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  36.07 
 
 		 520 aa  48.5  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  36.36 
 
 		 990 aa  48.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  26.44 
 
 		 748 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  30.43 
 
 		 750 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  30.77 
 
 		 851 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  30.38 
 
 		 615 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  32.53 
 
 		 489 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  27.71 
 
 		 902 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1270 aa  45.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  33.33 
 
 		 475 aa  44.7  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  39.62 
 
 		 668 aa  44.3  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  34.33 
 
 		 294 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  29.36 
 
 		 595 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  30.65 
 
 		 908 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  25.56 
 
 		 468 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  35.38 
 
 		 1061 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  29.03 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  35 
 
 		 468 aa  42  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  32.47 
 
 		 565 aa  42  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  27.62 
 
 		 997 aa  41.6  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  33.93 
 
 		 578 aa  41.2  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>