138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2518 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 516 aa  1067    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  54.69 
 
 		 519 aa  585  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  55.38 
 
 		 512 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.74 
 
 		 538 aa  422  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  43.76 
 
 		 563 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.36 
 
 		 515 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  40.91 
 
 		 546 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  41.83 
 
 		 566 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.61 
 
 		 558 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  40.56 
 
 		 581 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  39.32 
 
 		 577 aa  362  8e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  41.27 
 
 		 517 aa  362  9e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  40.23 
 
 		 556 aa  351  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  41.23 
 
 		 497 aa  343  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  39.11 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  36.98 
 
 		 512 aa  333  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  38.81 
 
 		 484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  39.07 
 
 		 532 aa  317  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  38.1 
 
 		 542 aa  316  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.79 
 
 		 547 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  37.21 
 
 		 523 aa  306  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  36.52 
 
 		 550 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  35.88 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  34.86 
 
 		 571 aa  289  9e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.86 
 
 		 539 aa  283  7.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  33.98 
 
 		 498 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.1 
 
 		 546 aa  282  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.61 
 
 		 536 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.65 
 
 		 537 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.88 
 
 		 537 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  39.91 
 
 		 541 aa  263  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  48.45 
 
 		 451 aa  261  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 		 492 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.77 
 
 		 541 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.69 
 
 		 488 aa  253  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  33.99 
 
 		 526 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  32.48 
 
 		 539 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  33.4 
 
 		 586 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 		 636 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  33.02 
 
 		 540 aa  227  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  42.41 
 
 		 497 aa  220  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.22 
 
 		 559 aa  217  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  32.6 
 
 		 546 aa  217  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  27.61 
 
 		 590 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.63 
 
 		 558 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  29.08 
 
 		 553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  28.25 
 
 		 552 aa  184  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  27.73 
 
 		 591 aa  174  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 		 572 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 		 543 aa  158  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  26.08 
 
 		 551 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  27.68 
 
 		 560 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  28.98 
 
 		 1195 aa  153  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 		 504 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  28.22 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.6 
 
 		 562 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 		 532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  26.89 
 
 		 650 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  27.1 
 
 		 522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 		 665 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.62 
 
 		 536 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  26.65 
 
 		 530 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  27.55 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  30.65 
 
 		 1338 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  26.2 
 
 		 746 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  27.03 
 
 		 522 aa  137  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 		 547 aa  136  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  31.04 
 
 		 521 aa  134  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  29.53 
 
 		 525 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 511 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  32.7 
 
 		 537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.1 
 
 		 540 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 		 537 aa  127  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.19 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  25.05 
 
 		 797 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  32.54 
 
 		 527 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 		 534 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25.95 
 
 		 1585 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  24.1 
 
 		 500 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  28.62 
 
 		 545 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  26.06 
 
 		 472 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  26.08 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  25.8 
 
 		 691 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  24.72 
 
 		 1474 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  40.85 
 
 		 343 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  30.18 
 
 		 365 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  23.27 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.05 
 
 		 522 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  24.42 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  30.69 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  24.24 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  26.39 
 
 		 532 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.71 
 
 		 699 aa  78.2  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  22.13 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.95 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  25.89 
 
 		 901 aa  70.9  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  27.02 
 
 		 855 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.97 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>