101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3875 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
518 aa  1063    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  60.2 
 
 
518 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  65.18 
 
 
530 aa  748    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  53 
 
 
1585 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  45.36 
 
 
500 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  39.88 
 
 
508 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  49.05 
 
 
1338 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 
665 aa  302  8.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  34.98 
 
 
746 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  32.22 
 
 
1195 aa  261  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  34.5 
 
 
691 aa  257  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  31.76 
 
 
503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  32.21 
 
 
532 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  31.63 
 
 
521 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 
504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  35.8 
 
 
901 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 
532 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 
572 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 
543 aa  169  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  28.68 
 
 
560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.22 
 
 
536 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.51 
 
 
562 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  28.51 
 
 
519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  26.41 
 
 
551 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  27.42 
 
 
522 aa  153  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  25.14 
 
 
522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  27.96 
 
 
522 aa  148  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  28.17 
 
 
566 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 
512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  27.97 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  29.08 
 
 
527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 
516 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.24 
 
 
515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.65 
 
 
577 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  25.67 
 
 
512 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.87 
 
 
538 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 
563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  24.48 
 
 
496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.3 
 
 
558 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 
581 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  24.62 
 
 
517 aa  118  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  24.49 
 
 
556 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 
571 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  25.88 
 
 
497 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.6 
 
 
536 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  27.09 
 
 
532 aa  107  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 
636 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 
514 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  24.79 
 
 
542 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.8 
 
 
546 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.05 
 
 
523 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 
498 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  23.74 
 
 
550 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  24.53 
 
 
1474 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  26.8 
 
 
451 aa  97.4  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.46 
 
 
547 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.36 
 
 
539 aa  95.9  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  23.98 
 
 
526 aa  94  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  24.68 
 
 
650 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.04 
 
 
546 aa  91.3  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  24.68 
 
 
484 aa  91.3  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  26.76 
 
 
586 aa  90.1  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.21 
 
 
541 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.05 
 
 
537 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.41 
 
 
488 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  23.25 
 
 
497 aa  84  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  28.23 
 
 
553 aa  83.2  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  28.7 
 
 
522 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.83 
 
 
537 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  23.75 
 
 
524 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  26.14 
 
 
539 aa  80.9  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 
492 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 
540 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.12 
 
 
559 aa  78.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  25.27 
 
 
541 aa  77.8  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  24.47 
 
 
534 aa  77  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  25.65 
 
 
552 aa  74.7  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  23.22 
 
 
797 aa  74.3  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 
537 aa  73.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  22.49 
 
 
547 aa  73.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  24.42 
 
 
537 aa  73.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.04 
 
 
558 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  24.19 
 
 
495 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  23.3 
 
 
501 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  26.33 
 
 
535 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.33 
 
 
540 aa  67  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  27.85 
 
 
348 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.158232 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  35.48 
 
 
591 aa  64.7  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  24.26 
 
 
545 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  27.97 
 
 
472 aa  60.1  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  23.21 
 
 
511 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 
345 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 
319 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  24.35 
 
 
325 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  22.41 
 
 
472 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  21.3 
 
 
546 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  23.25 
 
 
365 aa  47.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  22.66 
 
 
315 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  25.53 
 
 
855 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  23.81 
 
 
503 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>