116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1251 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 665 aa  1365    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  36.98 
 
 		 530 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  37.57 
 
 		 518 aa  324  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  34.23 
 
 		 746 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  35.99 
 
 		 1195 aa  303  8.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 		 518 aa  302  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  36.16 
 
 		 521 aa  297  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  33.14 
 
 		 1585 aa  282  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  32.77 
 
 		 500 aa  267  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  33.75 
 
 		 532 aa  256  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  34.22 
 
 		 691 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  33.07 
 
 		 503 aa  253  6e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  35.76 
 
 		 504 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  37.09 
 
 		 1338 aa  243  9e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 		 508 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  31.14 
 
 		 572 aa  217  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.44 
 
 		 562 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  29.43 
 
 		 536 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  28.21 
 
 		 522 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  29.42 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  28.75 
 
 		 560 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  28.65 
 
 		 522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 		 543 aa  169  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  27.84 
 
 		 522 aa  161  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.24 
 
 		 536 aa  147  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  31.46 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  27.55 
 
 		 525 aa  144  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 		 516 aa  141  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.46 
 
 		 539 aa  140  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 514 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  27.27 
 
 		 527 aa  134  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  27.42 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  30.49 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.82 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  30.55 
 
 		 901 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  27.07 
 
 		 550 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.29 
 
 		 523 aa  128  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  27.29 
 
 		 532 aa  127  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.97 
 
 		 577 aa  127  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  27.29 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  28.61 
 
 		 563 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  28.78 
 
 		 484 aa  118  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.3 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  27.45 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  25.35 
 
 		 650 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.45 
 
 		 546 aa  111  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.82 
 
 		 558 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.8 
 
 		 541 aa  110  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 636 aa  108  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  29.97 
 
 		 497 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.53 
 
 		 546 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  27.12 
 
 		 496 aa  104  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.4 
 
 		 547 aa  104  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  28.44 
 
 		 526 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  29.46 
 
 		 542 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  29.14 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  23.18 
 
 		 571 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  26.93 
 
 		 492 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  24.52 
 
 		 539 aa  100  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.76 
 
 		 488 aa  99.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  27.65 
 
 		 586 aa  96.3  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  28.09 
 
 		 546 aa  95.5  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.11 
 
 		 559 aa  94.7  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  27.12 
 
 		 541 aa  94  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.22 
 
 		 537 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.48 
 
 		 537 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  32.07 
 
 		 540 aa  87.8  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  25.24 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.54 
 
 		 558 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  27.11 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.29 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  24 
 
 		 1474 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.85 
 
 		 524 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  24.81 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  34.42 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.06 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  25.3 
 
 		 547 aa  75.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  27.24 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  24.8 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  25.19 
 
 		 553 aa  73.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  24.48 
 
 		 797 aa  72  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  26.5 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  32.43 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  33.07 
 
 		 545 aa  65.1  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.93 
 
 		 699 aa  60.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.41 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 		 340 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  22.51 
 
 		 495 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.85 
 
 		 393 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  29.56 
 
 		 304 aa  53.9  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  21.59 
 
 		 472 aa  53.9  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  29.17 
 
 		 384 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  26.98 
 
 		 537 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  22.41 
 
 		 501 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>