73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0822 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  100 
 
 		 385 aa  795    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  63.97 
 
 		 383 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  66.98 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  64.13 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  59.94 
 
 		 367 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  63.95 
 
 		 344 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  62.07 
 
 		 326 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.25 
 
 		 330 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  60.19 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.65 
 
 		 320 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  52.99 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  52.5 
 
 		 335 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.96 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  36.11 
 
 		 450 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  34.15 
 
 		 468 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  34.05 
 
 		 533 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.83 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  31.02 
 
 		 348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  35.26 
 
 		 315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  33.54 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  32.51 
 
 		 618 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  34.65 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  31.37 
 
 		 524 aa  143  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  34.65 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  32.25 
 
 		 1186 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  29.91 
 
 		 509 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  33.74 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  33.63 
 
 		 535 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  31.12 
 
 		 679 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  33.13 
 
 		 317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  32.93 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  27.99 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  29.52 
 
 		 302 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  31.31 
 
 		 527 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.1 
 
 		 712 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  26.72 
 
 		 1338 aa  94  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  26.61 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  27.3 
 
 		 324 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  27.46 
 
 		 323 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  25.13 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  29.59 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  29.63 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  25.74 
 
 		 667 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  28.69 
 
 		 644 aa  80.5  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  26.32 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.17 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  28.39 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  23.99 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  27.23 
 
 		 315 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  26.02 
 
 		 393 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  25.69 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  26.69 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.86 
 
 		 640 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  24.27 
 
 		 506 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  27.31 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  27.4 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  25.56 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 325 aa  47  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.93 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.28 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.25 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  25.45 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3298  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 593 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.17 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.65 
 
 		 576 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 		 543 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4540  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.08 
 
 		 616 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  22.98 
 
 		 465 aa  43.1  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>