26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4540 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4540  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
616 aa  1281    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3298  coagulation factor 5/8 type domain protein  72.77 
 
 
593 aa  919    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.38 
 
 
640 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.99 
 
 
576 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 
506 aa  133  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 
325 aa  64.3  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.84 
 
 
306 aa  55.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  25.29 
 
 
319 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 
512 aa  51.2  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  22 
 
 
855 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.29 
 
 
367 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.01 
 
 
577 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  22.95 
 
 
315 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.03 
 
 
537 aa  47.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  29.38 
 
 
326 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1547  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.89 
 
 
1050 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.03 
 
 
537 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1604  hypothetical protein  30.89 
 
 
1050 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.66 
 
 
344 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  25.37 
 
 
704 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.73 
 
 
523 aa  45.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 
498 aa  44.3  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 
644 aa  44.3  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  25.33 
 
 
540 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  27.14 
 
 
327 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.85 
 
 
319 aa  43.9  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>