33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2947 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  100 
 
 		 574 aa  1168    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  47.33 
 
 		 700 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  30.95 
 
 		 552 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3779  pectate lyase  33.74 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1159  pectate lyase  33.12 
 
 		 354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  31.62 
 
 		 666 aa  147  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4116  pectate lyase  30.55 
 
 		 396 aa  137  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0380  pectate lyase  31.51 
 
 		 416 aa  124  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  47.45 
 
 		 772 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1434  pectate lyase  31.16 
 
 		 460 aa  115  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  47.37 
 
 		 914 aa  110  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  40.44 
 
 		 769 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  39.86 
 
 		 789 aa  98.2  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  39.55 
 
 		 1316 aa  97.1  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  52.36 
 
 		 747 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  34.4 
 
 		 511 aa  91.3  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  38.31 
 
 		 649 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  41.94 
 
 		 540 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.54 
 
 		 809 aa  77  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  37.7 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  33.96 
 
 		 820 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  37.62 
 
 		 847 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.64 
 
 		 831 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  30.47 
 
 		 554 aa  60.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1698  hypothetical protein  25.24 
 
 		 547 aa  60.1  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498115  normal  0.0888224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  33.55 
 
 		 2073 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3331  carbohydrate-binding family 6 protein  31.25 
 
 		 747 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  32.87 
 
 		 1128 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  35.88 
 
 		 1000 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  33.33 
 
 		 938 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  26.42 
 
 		 1016 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  34.52 
 
 		 869 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  28.95 
 
 		 1207 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>