66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0103 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  698    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.86 
 
 		 649 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  28.3 
 
 		 600 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  35.5 
 
 		 1312 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.63 
 
 		 749 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  30.9 
 
 		 640 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.55 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  35.78 
 
 		 688 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  35.17 
 
 		 962 aa  91.3  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.73 
 
 		 795 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  33.33 
 
 		 1916 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.04 
 
 		 543 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  31.58 
 
 		 570 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  32.6 
 
 		 1045 aa  87.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.13 
 
 		 706 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  33.96 
 
 		 976 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  33.78 
 
 		 637 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.2 
 
 		 860 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  34.35 
 
 		 998 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.56 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  28.76 
 
 		 538 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  34.54 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.72 
 
 		 530 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.93 
 
 		 619 aa  69.3  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  29.47 
 
 		 589 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.17 
 
 		 600 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.05 
 
 		 885 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  34.01 
 
 		 1073 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.35 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.62 
 
 		 833 aa  64.3  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.8 
 
 		 1059 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  27.34 
 
 		 1550 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.39 
 
 		 871 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  32.89 
 
 		 1037 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.52 
 
 		 847 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  31.31 
 
 		 1452 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  28.64 
 
 		 600 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.17 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.96 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.57 
 
 		 769 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  35.85 
 
 		 554 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  37.42 
 
 		 551 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  33.68 
 
 		 635 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.52 
 
 		 2884 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.7 
 
 		 1412 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  34.25 
 
 		 848 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  31.51 
 
 		 643 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  36.53 
 
 		 841 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.39 
 
 		 624 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  32.79 
 
 		 682 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  32.67 
 
 		 678 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  31.48 
 
 		 661 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.47 
 
 		 1135 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.43 
 
 		 905 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  31.41 
 
 		 673 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  35.17 
 
 		 297 aa  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  34.25 
 
 		 627 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  34.91 
 
 		 635 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.48 
 
 		 464 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.69 
 
 		 684 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  31.33 
 
 		 688 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  33.54 
 
 		 1192 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.15 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1779  hypothetical protein  33.16 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362511  normal  0.842634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.94 
 
 		 719 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  27.67 
 
 		 714 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>