116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0218 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  100 
 
 		 848 aa  1677    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.29 
 
 		 905 aa  303  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.19 
 
 		 885 aa  280  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.1 
 
 		 871 aa  270  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  46.26 
 
 		 442 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.9 
 
 		 464 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.25 
 
 		 600 aa  234  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  44.8 
 
 		 847 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  38.59 
 
 		 643 aa  227  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  41.41 
 
 		 682 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  35.59 
 
 		 589 aa  208  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  42.05 
 
 		 1192 aa  207  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.85 
 
 		 1412 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  40.98 
 
 		 998 aa  190  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  38.65 
 
 		 554 aa  187  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.06 
 
 		 684 aa  187  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  42.39 
 
 		 1037 aa  180  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  40.24 
 
 		 976 aa  180  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.88 
 
 		 448 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  37.17 
 
 		 635 aa  164  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  39.77 
 
 		 714 aa  162  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  40.64 
 
 		 1073 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.18 
 
 		 624 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  34.53 
 
 		 688 aa  154  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.36 
 
 		 656 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  38.06 
 
 		 673 aa  140  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  38.46 
 
 		 609 aa  139  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  35.64 
 
 		 627 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.19 
 
 		 386 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.52 
 
 		 706 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  33.24 
 
 		 1045 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  31.27 
 
 		 640 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  34.29 
 
 		 661 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  35.71 
 
 		 678 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  34.08 
 
 		 663 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  30.03 
 
 		 570 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  33.82 
 
 		 688 aa  118  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  29.23 
 
 		 600 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  30.03 
 
 		 962 aa  113  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  30.86 
 
 		 1550 aa  108  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  33.97 
 
 		 635 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.11 
 
 		 510 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.83 
 
 		 719 aa  103  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  29.36 
 
 		 1312 aa  101  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  29.65 
 
 		 637 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.39 
 
 		 326 aa  99.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  30.45 
 
 		 1452 aa  98.2  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.74 
 
 		 860 aa  98.2  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.03 
 
 		 2884 aa  97.8  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.11 
 
 		 543 aa  97.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.2 
 
 		 795 aa  95.5  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.27 
 
 		 649 aa  92.8  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  32.53 
 
 		 667 aa  91.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  28.24 
 
 		 600 aa  90.5  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  27.41 
 
 		 538 aa  87  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.46 
 
 		 769 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  28.72 
 
 		 833 aa  79.7  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  35.71 
 
 		 841 aa  79.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.02 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.2 
 
 		 619 aa  77.8  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.22 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  28.45 
 
 		 1916 aa  67  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.13 
 
 		 600 aa  62.4  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  34.59 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  30.89 
 
 		 297 aa  55.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  28.42 
 
 		 1528 aa  55.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.2 
 
 		 749 aa  54.7  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  30.17 
 
 		 679 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  34.59 
 
 		 468 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.55 
 
 		 475 aa  53.5  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  31.52 
 
 		 752 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  30.99 
 
 		 941 aa  51.6  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  37.19 
 
 		 759 aa  51.6  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  31.84 
 
 		 685 aa  51.2  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.63 
 
 		 1059 aa  50.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  37.06 
 
 		 677 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  27.13 
 
 		 861 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  30.68 
 
 		 791 aa  49.3  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.89 
 
 		 2272 aa  48.9  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  28.49 
 
 		 1300 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1282 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 910 aa  48.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.53 
 
 		 930 aa  48.1  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  29.44 
 
 		 581 aa  48.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  31.82 
 
 		 669 aa  48.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  33.33 
 
 		 735 aa  47.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  29.67 
 
 		 551 aa  48.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  32.58 
 
 		 963 aa  47.8  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  28.98 
 
 		 713 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.49 
 
 		 2036 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  27.93 
 
 		 1842 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  28.73 
 
 		 547 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  36.29 
 
 		 951 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  28.93 
 
 		 565 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2574  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.35 
 
 		 497 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.053652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  27.93 
 
 		 1241 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  27.22 
 
 		 978 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  33.08 
 
 		 370 aa  47  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  40.54 
 
 		 1667 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  27.93 
 
 		 1882 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>