76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0348 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 		 847 aa  1718    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  52.42 
 
 		 442 aa  270  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  48.4 
 
 		 1192 aa  260  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  50 
 
 		 905 aa  251  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  46.13 
 
 		 848 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  38.31 
 
 		 589 aa  240  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  49.21 
 
 		 871 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  48.2 
 
 		 1412 aa  230  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  46.57 
 
 		 885 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  46.69 
 
 		 464 aa  223  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  47.51 
 
 		 682 aa  221  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.89 
 
 		 600 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2295  hypothetical protein  31.59 
 
 		 456 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0177107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  45.86 
 
 		 998 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  47.24 
 
 		 684 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  45.94 
 
 		 976 aa  208  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  43.95 
 
 		 643 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  42.73 
 
 		 661 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  45.15 
 
 		 554 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2301  hypothetical protein  32.35 
 
 		 457 aa  201  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000171205  normal  0.0280114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  40.84 
 
 		 635 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  41.75 
 
 		 678 aa  185  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  42.68 
 
 		 1073 aa  183  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  40.38 
 
 		 1037 aa  183  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  40.23 
 
 		 673 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  37.17 
 
 		 688 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  42.15 
 
 		 627 aa  180  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.88 
 
 		 656 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.86 
 
 		 448 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.24 
 
 		 624 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  39.32 
 
 		 714 aa  170  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  40.3 
 
 		 609 aa  168  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.91 
 
 		 386 aa  156  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  33.33 
 
 		 640 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  33.76 
 
 		 637 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33 
 
 		 326 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.54 
 
 		 769 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  34.66 
 
 		 663 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  40.06 
 
 		 635 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.93 
 
 		 706 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.69 
 
 		 795 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  30.41 
 
 		 600 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  35.89 
 
 		 688 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  28.98 
 
 		 570 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  41.91 
 
 		 841 aa  135  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  32.4 
 
 		 1045 aa  132  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.97 
 
 		 860 aa  127  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.67 
 
 		 649 aa  126  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.35 
 
 		 543 aa  122  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.76 
 
 		 719 aa  121  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  36.39 
 
 		 667 aa  121  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  33.24 
 
 		 962 aa  120  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  33.03 
 
 		 1550 aa  118  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  32.65 
 
 		 1312 aa  117  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.83 
 
 		 510 aa  114  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.53 
 
 		 2884 aa  114  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.17 
 
 		 619 aa  111  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  30.91 
 
 		 1452 aa  108  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  31.34 
 
 		 538 aa  107  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  26.09 
 
 		 600 aa  96.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.8 
 
 		 600 aa  85.9  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.52 
 
 		 530 aa  84  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.02 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  27.56 
 
 		 833 aa  75.5  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  35.97 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.22 
 
 		 475 aa  73.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  27.81 
 
 		 1916 aa  71.6  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.43 
 
 		 749 aa  71.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.04 
 
 		 1135 aa  65.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.51 
 
 		 1060 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  33.57 
 
 		 370 aa  59.7  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.72 
 
 		 1059 aa  59.3  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  28.91 
 
 		 330 aa  53.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0884  hypothetical protein  37.89 
 
 		 312 aa  49.3  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.172772  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.48 
 
 		 551 aa  45.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1719  hypothetical protein  33.68 
 
 		 296 aa  45.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.436251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>