86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0428 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 
833 aa  1624    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.86 
 
 
326 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  32.51 
 
 
640 aa  108  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.71 
 
 
795 aa  104  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  27.46 
 
 
570 aa  103  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.4 
 
 
342 aa  99.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  33.01 
 
 
1312 aa  97.4  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.77 
 
 
649 aa  97.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.91 
 
 
905 aa  94.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  29.23 
 
 
688 aa  92.8  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  26.38 
 
 
600 aa  92  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.86 
 
 
530 aa  92  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  32.35 
 
 
962 aa  90.9  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.23 
 
 
706 aa  88.6  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.14 
 
 
871 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  32 
 
 
1045 aa  86.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.57 
 
 
600 aa  86.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.75 
 
 
885 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.44 
 
 
769 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  34.47 
 
 
600 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  28.62 
 
 
637 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.82 
 
 
510 aa  84  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.41 
 
 
1412 aa  81.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  30.2 
 
 
1550 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.47 
 
 
475 aa  79.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  28.72 
 
 
848 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  30.75 
 
 
1037 aa  78.2  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  27.72 
 
 
643 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.56 
 
 
1059 aa  76.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  37.98 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  33.67 
 
 
1452 aa  73.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  30.03 
 
 
554 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.3 
 
 
619 aa  71.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  35.05 
 
 
442 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31 
 
 
2884 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  35.33 
 
 
1073 aa  69.7  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.48 
 
 
551 aa  68.6  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  28.71 
 
 
663 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  35.23 
 
 
998 aa  67.8  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.11 
 
 
847 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  29.56 
 
 
609 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  38.52 
 
 
1192 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.24 
 
 
600 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
409 aa  64.7  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  30.72 
 
 
976 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  29.81 
 
 
1916 aa  63.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.56 
 
 
543 aa  63.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  29.29 
 
 
661 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.47 
 
 
448 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  32.64 
 
 
589 aa  61.6  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  28.06 
 
 
635 aa  60.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
414 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.27 
 
 
624 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  31.25 
 
 
688 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.25 
 
 
464 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  34.52 
 
 
297 aa  58.5  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.1 
 
 
656 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.57 
 
 
386 aa  56.2  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  27.17 
 
 
841 aa  56.6  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  28.85 
 
 
678 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  27.94 
 
 
370 aa  55.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
426 aa  54.7  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  27.37 
 
 
538 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  29.14 
 
 
714 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.9 
 
 
684 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
409 aa  51.2  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.38 
 
 
719 aa  50.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.55 
 
 
749 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  27.63 
 
 
667 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
410 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  28.3 
 
 
627 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  27.47 
 
 
673 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.31 
 
 
860 aa  49.3  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
394 aa  48.5  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 
400 aa  48.5  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
396 aa  48.1  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  26.39 
 
 
682 aa  47.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  51.11 
 
 
404 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  32.53 
 
 
928 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
403 aa  45.8  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1719  hypothetical protein  28.19 
 
 
296 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.436251 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0405  PKD domain-containing protein  40.74 
 
 
1141 aa  45.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  31.4 
 
 
635 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
395 aa  44.3  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  42.05 
 
 
409 aa  44.3  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>