103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0216 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 
663 aa  1297    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.75 
 
 
624 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  35.03 
 
 
635 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  37.5 
 
 
673 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.55 
 
 
656 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  32.85 
 
 
688 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  35.91 
 
 
661 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  34.43 
 
 
714 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 
678 aa  164  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  34.38 
 
 
667 aa  157  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  40.98 
 
 
627 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  41.53 
 
 
1073 aa  153  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  37.28 
 
 
589 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  38.66 
 
 
609 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.91 
 
 
847 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  37.88 
 
 
442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.5 
 
 
386 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  31.4 
 
 
635 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  38.54 
 
 
1037 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.08 
 
 
1412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.28 
 
 
719 aa  133  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.75 
 
 
464 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  36.42 
 
 
1192 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  38.57 
 
 
841 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  32.43 
 
 
848 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.83 
 
 
885 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  34.71 
 
 
682 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  33.53 
 
 
976 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  35.71 
 
 
554 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.09 
 
 
905 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.44 
 
 
684 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  35.35 
 
 
998 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.86 
 
 
871 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  34.11 
 
 
643 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.28 
 
 
448 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.48 
 
 
510 aa  109  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.27 
 
 
769 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.56 
 
 
706 aa  107  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.15 
 
 
600 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  33.13 
 
 
688 aa  103  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.94 
 
 
543 aa  100  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  28.17 
 
 
1550 aa  91.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  26.04 
 
 
600 aa  90.5  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  28.83 
 
 
570 aa  89  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.31 
 
 
860 aa  87.8  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.27 
 
 
326 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.68 
 
 
619 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  30.08 
 
 
637 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.09 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  27.57 
 
 
1452 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  26.38 
 
 
538 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.57 
 
 
2884 aa  79  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  28.12 
 
 
600 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  30.6 
 
 
1916 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.92 
 
 
649 aa  75.1  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  22.81 
 
 
795 aa  72  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  27.68 
 
 
1045 aa  71.6  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  28.71 
 
 
833 aa  71.2  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.86 
 
 
600 aa  71.2  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.34 
 
 
530 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  28.78 
 
 
962 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.08 
 
 
342 aa  65.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  30.33 
 
 
1312 aa  64.3  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  24.92 
 
 
640 aa  63.9  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.41 
 
 
407 aa  57.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 
676 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  34.41 
 
 
297 aa  52.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.24 
 
 
407 aa  51.2  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  26.48 
 
 
436 aa  50.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  28.32 
 
 
415 aa  49.7  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  34.62 
 
 
439 aa  48.9  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.61 
 
 
749 aa  48.5  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3384  WD40 domain protein beta Propeller  27.17 
 
 
398 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.749473  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  26.19 
 
 
403 aa  48.1  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  23.95 
 
 
656 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  26.63 
 
 
429 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  25.43 
 
 
421 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  24.22 
 
 
440 aa  47.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  24.22 
 
 
437 aa  47.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  24.87 
 
 
918 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  28.42 
 
 
1031 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  29.05 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  29.46 
 
 
430 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2883  transcriptional regulator domain-containing protein  24.38 
 
 
716 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.011265  hitchhiker  0.0000000742237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  30.89 
 
 
293 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  33.33 
 
 
435 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  26.51 
 
 
449 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  26.45 
 
 
427 aa  45.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0187  hypothetical protein  32.2 
 
 
672 aa  45.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  26.11 
 
 
434 aa  45.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  33.33 
 
 
1076 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  32.69 
 
 
441 aa  44.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  25.49 
 
 
330 aa  44.7  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  25.3 
 
 
432 aa  44.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  31.73 
 
 
461 aa  44.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1318  hypothetical protein  31.36 
 
 
664 aa  44.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  30.82 
 
 
444 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  23.95 
 
 
427 aa  44.3  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  22.4 
 
 
717 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  22.32 
 
 
450 aa  44.3  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>