78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3546 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 		 510 aa  961    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.72 
 
 		 706 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.25 
 
 		 871 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.78 
 
 		 624 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  36.76 
 
 		 1045 aa  158  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  43.11 
 
 		 600 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.19 
 
 		 885 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.03 
 
 		 769 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  38.01 
 
 		 635 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  35.14 
 
 		 1452 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.96 
 
 		 684 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.62 
 
 		 2884 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  33.87 
 
 		 1550 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  39.09 
 
 		 1037 aa  146  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  37.03 
 
 		 962 aa  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  36.15 
 
 		 976 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.38 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  40.33 
 
 		 1073 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  30.65 
 
 		 600 aa  143  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  32.34 
 
 		 600 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  31.88 
 
 		 570 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  31.79 
 
 		 640 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.03 
 
 		 860 aa  136  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.6 
 
 		 1412 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.06 
 
 		 905 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.94 
 
 		 619 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  36.27 
 
 		 554 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  35.47 
 
 		 1312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  38.53 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.95 
 
 		 464 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.33 
 
 		 649 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  32.8 
 
 		 538 aa  127  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.04 
 
 		 656 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 682 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.74 
 
 		 543 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  37.95 
 
 		 688 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  33.42 
 
 		 643 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  34.23 
 
 		 688 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  33.79 
 
 		 673 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.35 
 
 		 795 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  36.54 
 
 		 998 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  35.09 
 
 		 627 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  30.11 
 
 		 848 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  31.27 
 
 		 637 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  35.88 
 
 		 714 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.31 
 
 		 719 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  38.46 
 
 		 635 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  38.08 
 
 		 841 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.71 
 
 		 600 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  36.69 
 
 		 1192 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.42 
 
 		 847 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  32.52 
 
 		 609 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.78 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  38.83 
 
 		 663 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  34.53 
 
 		 661 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  35.57 
 
 		 678 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.43 
 
 		 386 aa  107  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.33 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  28.42 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.88 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.22 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  34.5 
 
 		 667 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  33.56 
 
 		 1916 aa  101  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.94 
 
 		 749 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.21 
 
 		 833 aa  91.7  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  40 
 
 		 551 aa  84.3  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.53 
 
 		 1135 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.95 
 
 		 1059 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  40.22 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  30.17 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2571  hypothetical protein  28.45 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.819404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  37.3 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1359  hypothetical protein  29.74 
 
 		 668 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000437253 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0893  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.53 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0405  PKD domain-containing protein  28.38 
 
 		 1141 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0183  hypothetical protein  29.9 
 
 		 519 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0892  cell wall binding repeat 2-containing protein  29.17 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0187  hypothetical protein  29.59 
 
 		 672 aa  43.9  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>