79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8457 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 		 905 aa  1755    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.55 
 
 		 885 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.48 
 
 		 871 aa  363  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  34.32 
 
 		 848 aa  312  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  56.17 
 
 		 1412 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  49.69 
 
 		 847 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  46.87 
 
 		 464 aa  234  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  50 
 
 		 442 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  46.39 
 
 		 1192 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  47.57 
 
 		 1037 aa  211  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  41.58 
 
 		 554 aa  210  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  46.75 
 
 		 684 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  46.11 
 
 		 643 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  39.82 
 
 		 682 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  45.67 
 
 		 998 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.71 
 
 		 448 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  43.75 
 
 		 976 aa  188  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  43.04 
 
 		 624 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.54 
 
 		 656 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  35.73 
 
 		 589 aa  171  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.55 
 
 		 600 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  39.94 
 
 		 635 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  42.77 
 
 		 1073 aa  156  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  40.06 
 
 		 661 aa  155  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  39.08 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  38.6 
 
 		 688 aa  150  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  39.55 
 
 		 609 aa  149  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.69 
 
 		 706 aa  144  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  37.69 
 
 		 1045 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  38.82 
 
 		 678 aa  143  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.58 
 
 		 386 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  30.79 
 
 		 570 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  32.5 
 
 		 600 aa  138  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  36.12 
 
 		 714 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  36.71 
 
 		 962 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  35.09 
 
 		 688 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  34.97 
 
 		 1312 aa  132  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  32.8 
 
 		 538 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  37.89 
 
 		 635 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  31.67 
 
 		 640 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.1 
 
 		 510 aa  126  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.15 
 
 		 326 aa  125  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  32.88 
 
 		 637 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.44 
 
 		 769 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.54 
 
 		 543 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  37.43 
 
 		 627 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  36.59 
 
 		 663 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  31.21 
 
 		 1452 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.01 
 
 		 860 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  37.14 
 
 		 667 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.35 
 
 		 795 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.91 
 
 		 619 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.22 
 
 		 719 aa  110  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  38.32 
 
 		 841 aa  110  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  30.63 
 
 		 1550 aa  104  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.64 
 
 		 833 aa  103  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.89 
 
 		 2884 aa  101  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  26.92 
 
 		 600 aa  99.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.29 
 
 		 649 aa  99.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  31.8 
 
 		 1916 aa  94.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.22 
 
 		 530 aa  92.8  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.22 
 
 		 600 aa  82.4  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.56 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.76 
 
 		 749 aa  75.5  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.9 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  36.36 
 
 		 551 aa  63.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.94 
 
 		 1135 aa  60.1  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  30.57 
 
 		 468 aa  54.7  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  34.41 
 
 		 297 aa  52.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  31.96 
 
 		 352 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.63 
 
 		 1059 aa  48.9  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.85 
 
 		 512 aa  49.3  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.01 
 
 		 428 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  26.24 
 
 		 605 aa  48.5  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  31.63 
 
 		 1565 aa  47.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.64 
 
 		 500 aa  45.8  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  32.17 
 
 		 370 aa  45.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 330 aa  45.4  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  37.08 
 
 		 1602 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>