97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1849 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  100 
 
 
600 aa  1222    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  49.15 
 
 
640 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  49.24 
 
 
326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  44.22 
 
 
570 aa  251  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.76 
 
 
795 aa  240  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.69 
 
 
649 aa  223  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  37.78 
 
 
637 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.22 
 
 
706 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  31.03 
 
 
1550 aa  160  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  33.24 
 
 
1045 aa  160  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  32.46 
 
 
538 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.57 
 
 
860 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.39 
 
 
619 aa  153  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.63 
 
 
543 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.28 
 
 
2884 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.76 
 
 
749 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  33.44 
 
 
688 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  32.79 
 
 
962 aa  148  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  34.85 
 
 
1452 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.38 
 
 
769 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  33.94 
 
 
1312 aa  141  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  32.46 
 
 
1916 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  32.3 
 
 
1037 aa  135  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33 
 
 
905 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  31.73 
 
 
442 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.5 
 
 
847 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.91 
 
 
464 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.14 
 
 
885 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  29.34 
 
 
600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.45 
 
 
510 aa  121  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  31.35 
 
 
1192 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.49 
 
 
624 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  29.23 
 
 
848 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30 
 
 
871 aa  117  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  29.41 
 
 
589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.97 
 
 
1412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.83 
 
 
1059 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.92 
 
 
530 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.19 
 
 
342 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.51 
 
 
448 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  29.08 
 
 
688 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31 
 
 
386 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  32.34 
 
 
554 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  29.45 
 
 
609 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.22 
 
 
1073 aa  107  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  29.29 
 
 
998 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  32.97 
 
 
661 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32 
 
 
1135 aa  104  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  31.1 
 
 
976 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.21 
 
 
600 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.75 
 
 
684 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  28.44 
 
 
682 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  27.74 
 
 
635 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  27.3 
 
 
678 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.71 
 
 
475 aa  95.1  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  29.55 
 
 
714 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  27.92 
 
 
370 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  26.38 
 
 
833 aa  92.8  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.02 
 
 
600 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.52 
 
 
719 aa  91.3  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  28.02 
 
 
841 aa  90.1  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.87 
 
 
656 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  28.61 
 
 
643 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  27.92 
 
 
635 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.33 
 
 
551 aa  80.5  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  33.77 
 
 
673 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  31.3 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  24.86 
 
 
627 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  26.04 
 
 
663 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  43.59 
 
 
556 aa  74.7  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  26.64 
 
 
667 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  47.13 
 
 
437 aa  63.9  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  46.51 
 
 
526 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  38.36 
 
 
1821 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  28.81 
 
 
330 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  40.7 
 
 
2638 aa  58.9  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  42.68 
 
 
1009 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  45.05 
 
 
462 aa  56.6  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  28.57 
 
 
554 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  41.86 
 
 
1732 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  41.77 
 
 
1048 aa  54.3  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1966  hypothetical protein  39.36 
 
 
524 aa  51.6  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  36.47 
 
 
428 aa  50.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  37.04 
 
 
981 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  38.1 
 
 
466 aa  48.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3264  Ig domain-containing protein  34.09 
 
 
262 aa  48.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  28.87 
 
 
1300 aa  47.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  21.63 
 
 
605 aa  47.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  40.23 
 
 
306 aa  47.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1720  aminoacyl-tRNA synthetase, class II  31.82 
 
 
288 aa  47.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.980612  normal  0.790966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  34.83 
 
 
1965 aa  47.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  50 
 
 
1418 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  40.23 
 
 
1937 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0187  hypothetical protein  34.51 
 
 
672 aa  45.8  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  40.23 
 
 
1467 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  40.74 
 
 
1831 aa  44.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  33.04 
 
 
390 aa  43.5  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>