77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0505 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 		 1412 aa  2803    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  57.45 
 
 		 885 aa  339  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  56.17 
 
 		 905 aa  285  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  48.06 
 
 		 871 aa  229  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  46.96 
 
 		 448 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  48.19 
 
 		 442 aa  216  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  47.5 
 
 		 847 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  42.18 
 
 		 848 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  45.35 
 
 		 998 aa  197  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  43.75 
 
 		 976 aa  192  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.62 
 
 		 464 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  42.3 
 
 		 1192 aa  187  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  42.02 
 
 		 1037 aa  179  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  42.95 
 
 		 554 aa  175  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  41.92 
 
 		 643 aa  172  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  39.18 
 
 		 635 aa  171  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.09 
 
 		 684 aa  171  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  41.96 
 
 		 682 aa  165  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  40.6 
 
 		 589 aa  164  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.2 
 
 		 624 aa  163  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.52 
 
 		 600 aa  161  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.43 
 
 		 656 aa  160  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  39.94 
 
 		 678 aa  155  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  41.31 
 
 		 1073 aa  154  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  38.99 
 
 		 673 aa  151  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.35 
 
 		 706 aa  148  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  37.5 
 
 		 714 aa  144  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  36.86 
 
 		 609 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  35.57 
 
 		 688 aa  137  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.22 
 
 		 386 aa  133  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  36.71 
 
 		 661 aa  132  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  29.49 
 
 		 570 aa  129  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  40.08 
 
 		 688 aa  129  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.71 
 
 		 795 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.46 
 
 		 860 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.09 
 
 		 769 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  36.72 
 
 		 663 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  35.52 
 
 		 627 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.6 
 
 		 510 aa  120  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  30.69 
 
 		 637 aa  119  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.71 
 
 		 326 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.42 
 
 		 2884 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  32.47 
 
 		 1550 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  38.27 
 
 		 635 aa  116  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  31.97 
 
 		 600 aa  116  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  30.46 
 
 		 538 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  31.56 
 
 		 1452 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.79 
 
 		 1045 aa  113  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.62 
 
 		 719 aa  106  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  33.33 
 
 		 640 aa  105  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.16 
 
 		 543 aa  104  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.63 
 
 		 649 aa  104  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  28.37 
 
 		 600 aa  103  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.32 
 
 		 530 aa  102  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  37.09 
 
 		 841 aa  102  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.95 
 
 		 619 aa  100  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  31.38 
 
 		 1312 aa  99.8  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  30.41 
 
 		 962 aa  95.9  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.65 
 
 		 600 aa  90.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  32.01 
 
 		 667 aa  85.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.22 
 
 		 749 aa  84.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  29.41 
 
 		 833 aa  84  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  30.2 
 
 		 1916 aa  82.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  36.54 
 
 		 468 aa  64.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.11 
 
 		 342 aa  63.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.1 
 
 		 475 aa  55.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  34.85 
 
 		 677 aa  54.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  39.16 
 
 		 297 aa  54.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  29.82 
 
 		 563 aa  52.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  34.17 
 
 		 370 aa  50.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.15 
 
 		 1135 aa  49.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  41.38 
 
 		 1057 aa  48.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.14 
 
 		 694 aa  46.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  28.92 
 
 		 707 aa  46.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  21.37 
 
 		 352 aa  46.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  32.81 
 
 		 520 aa  45.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  29.28 
 
 		 446 aa  45.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>