127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6568 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 		 871 aa  1724    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.8 
 
 		 885 aa  351  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.13 
 
 		 905 aa  340  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  34.38 
 
 		 848 aa  263  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  48.57 
 
 		 847 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  47.65 
 
 		 1412 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  38.99 
 
 		 589 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  40.38 
 
 		 643 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  46.67 
 
 		 442 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  37.58 
 
 		 554 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.71 
 
 		 448 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.59 
 
 		 464 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  40 
 
 		 682 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  44.69 
 
 		 1037 aa  185  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  43.89 
 
 		 976 aa  184  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  41.34 
 
 		 998 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  46.33 
 
 		 1073 aa  180  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  42.2 
 
 		 1192 aa  180  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.55 
 
 		 684 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.32 
 
 		 624 aa  176  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  40.06 
 
 		 635 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.4 
 
 		 600 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.4 
 
 		 656 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  38.75 
 
 		 714 aa  161  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.31 
 
 		 386 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  40.52 
 
 		 678 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  37.54 
 
 		 673 aa  154  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  41.23 
 
 		 609 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  40.66 
 
 		 627 aa  153  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  33.55 
 
 		 640 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  35.88 
 
 		 637 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  39.74 
 
 		 661 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  36.36 
 
 		 688 aa  147  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.48 
 
 		 510 aa  144  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  31.31 
 
 		 570 aa  144  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  34.71 
 
 		 1550 aa  142  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  34.8 
 
 		 1312 aa  142  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  35.47 
 
 		 962 aa  141  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  35.03 
 
 		 1045 aa  140  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.97 
 
 		 706 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.54 
 
 		 2884 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.36 
 
 		 795 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  40.44 
 
 		 635 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.77 
 
 		 649 aa  127  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  32.58 
 
 		 1452 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.56 
 
 		 769 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  35.26 
 
 		 688 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  30.23 
 
 		 600 aa  119  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.33 
 
 		 719 aa  117  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.82 
 
 		 326 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.33 
 
 		 619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  30.51 
 
 		 600 aa  111  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.85 
 
 		 860 aa  107  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  39.77 
 
 		 841 aa  106  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  28.25 
 
 		 538 aa  105  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  36.79 
 
 		 667 aa  105  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.64 
 
 		 663 aa  104  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.45 
 
 		 543 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.9 
 
 		 600 aa  94.4  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  32.14 
 
 		 833 aa  88.2  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.68 
 
 		 530 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.41 
 
 		 475 aa  80.5  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  36.43 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  36.58 
 
 		 551 aa  77  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.35 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  28.43 
 
 		 1916 aa  73.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.88 
 
 		 749 aa  69.7  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.9 
 
 		 1135 aa  67  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  34.59 
 
 		 370 aa  54.7  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  33.1 
 
 		 938 aa  54.7  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  29.71 
 
 		 547 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  30 
 
 		 1682 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  38 
 
 		 1150 aa  53.5  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  32.28 
 
 		 816 aa  52.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  29.33 
 
 		 1120 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.06 
 
 		 1059 aa  52.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.61 
 
 		 713 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30 
 
 		 2272 aa  51.6  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  32.54 
 
 		 1300 aa  51.6  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  27.17 
 
 		 1882 aa  51.6  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  38.41 
 
 		 1565 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  31.75 
 
 		 791 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  28.8 
 
 		 861 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  31.2 
 
 		 561 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  33.56 
 
 		 951 aa  50.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  52.31 
 
 		 2066 aa  50.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.97 
 
 		 3197 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  32.06 
 
 		 2036 aa  49.3  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  31.16 
 
 		 685 aa  48.9  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  27.17 
 
 		 1969 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  31.16 
 
 		 575 aa  48.9  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  30.82 
 
 		 1095 aa  48.5  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  32.1 
 
 		 869 aa  48.5  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  30.52 
 
 		 317 aa  48.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  31.61 
 
 		 1987 aa  48.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  40.7 
 
 		 917 aa  48.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  28.8 
 
 		 184 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  32.33 
 
 		 1842 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  29.84 
 
 		 1361 aa  47.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  32.91 
 
 		 3197 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>