21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5050 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  100 
 
 		 700 aa  1386    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  62.32 
 
 		 694 aa  849    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4305  hypothetical protein  56.72 
 
 		 237 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  28.46 
 
 		 698 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  39.65 
 
 		 546 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  27.75 
 
 		 659 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  38.76 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0230  hypothetical protein  28.81 
 
 		 653 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  36.32 
 
 		 667 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  37.43 
 
 		 683 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  32.74 
 
 		 310 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  36.26 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  34.91 
 
 		 611 aa  69.3  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  34.94 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  31.02 
 
 		 595 aa  65.1  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5016  hypothetical protein  31.4 
 
 		 706 aa  64.7  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  35.06 
 
 		 572 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  32.92 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  31.95 
 
 		 692 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1742  hypothetical protein  31.19 
 
 		 231 aa  50.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0658117  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  32.49 
 
 		 546 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>