15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0774 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0774  hypothetical protein  100 
 
 		 922 aa  1841    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.891032 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1631  hypothetical protein  29.12 
 
 		 922 aa  266  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.804906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  36.36 
 
 		 3507 aa  55.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  40.23 
 
 		 995 aa  53.9  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  35.16 
 
 		 527 aa  53.9  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  36 
 
 		 340 aa  52.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 480 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  31.15 
 
 		 853 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  39.73 
 
 		 836 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  33.98 
 
 		 1042 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  34.25 
 
 		 771 aa  45.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  37.18 
 
 		 4433 aa  44.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  34.02 
 
 		 670 aa  44.3  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  28.7 
 
 		 825 aa  44.3  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 673 aa  44.3  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>