211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0313 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0313  PKD domain-containing protein  100 
 
 
401 aa  791    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  63.27 
 
 
1700 aa  153  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  48.78 
 
 
1356 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  43.14 
 
 
2122 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  40.4 
 
 
2176 aa  76.3  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  48.31 
 
 
963 aa  76.3  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  44.9 
 
 
575 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  45.12 
 
 
684 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  42.53 
 
 
547 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  41.5 
 
 
2000 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  47.89 
 
 
460 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  52.17 
 
 
752 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  39.22 
 
 
978 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  48.81 
 
 
1236 aa  73.2  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  39.18 
 
 
615 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  40 
 
 
519 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  40 
 
 
735 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  42.31 
 
 
1862 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.84 
 
 
1842 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  39.09 
 
 
941 aa  71.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  50.75 
 
 
1969 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  39.58 
 
 
1682 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  46.25 
 
 
3295 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  39 
 
 
2272 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  38.35 
 
 
940 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  48.61 
 
 
2554 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  39.39 
 
 
1094 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  42.35 
 
 
1882 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  42.05 
 
 
791 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  43.27 
 
 
561 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  34.48 
 
 
1830 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  41.05 
 
 
1300 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40.82 
 
 
1241 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  41.67 
 
 
1120 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
1732 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  43.75 
 
 
1667 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  47.06 
 
 
1528 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  46.27 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  42.35 
 
 
644 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  51.32 
 
 
1328 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  50 
 
 
1361 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  45.45 
 
 
848 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  41.57 
 
 
859 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  39.8 
 
 
551 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  33.9 
 
 
713 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  46.75 
 
 
819 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  42.86 
 
 
685 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  36.89 
 
 
958 aa  66.6  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  33.93 
 
 
528 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  43.06 
 
 
1667 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  39.39 
 
 
560 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  41.77 
 
 
581 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  41.84 
 
 
2036 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  52.31 
 
 
802 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  40.66 
 
 
679 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  45.35 
 
 
669 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  46.48 
 
 
1380 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  45 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  44.71 
 
 
769 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  41.77 
 
 
658 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  39.77 
 
 
861 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  42.5 
 
 
838 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  44.78 
 
 
1620 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  38.89 
 
 
1042 aa  63.5  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  39.36 
 
 
675 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  32.19 
 
 
408 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  56.67 
 
 
816 aa  63.2  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  54 
 
 
845 aa  63.2  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  45.78 
 
 
374 aa  62.8  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  37.25 
 
 
1931 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  40.26 
 
 
530 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  46.05 
 
 
1311 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  39.17 
 
 
869 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  42.5 
 
 
500 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  43.94 
 
 
823 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  41.89 
 
 
1282 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  49.21 
 
 
870 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  47.69 
 
 
719 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  43.08 
 
 
840 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  39.29 
 
 
910 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  33.53 
 
 
938 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  49.18 
 
 
1531 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  32.37 
 
 
465 aa  60.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  40.91 
 
 
971 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  44.59 
 
 
1001 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  41.84 
 
 
930 aa  59.7  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  44.3 
 
 
1056 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  34.91 
 
 
567 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  49.02 
 
 
1292 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  40.7 
 
 
1092 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  36.36 
 
 
1814 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  41.67 
 
 
1387 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  51.61 
 
 
525 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  47.37 
 
 
1189 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  37.63 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  25.51 
 
 
587 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
786 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
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NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  37.1 
 
 
505 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
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NC_007796  Mhun_1683  PKD  35.96 
 
 
211 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
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NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  36.96 
 
 
960 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
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