58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4242 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4242  hypothetical protein  100 
 
 
903 aa  1838    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37715  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1484  hypothetical protein  33.47 
 
 
937 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188972  normal  0.663437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.64 
 
 
1783 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.85 
 
 
1797 aa  201  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.17 
 
 
1773 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  29.17 
 
 
1351 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  29.4 
 
 
2552 aa  110  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.76 
 
 
1726 aa  101  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.46 
 
 
1343 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  27.51 
 
 
2030 aa  99.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.2 
 
 
1231 aa  98.2  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4157  S-layer domain protein  28.39 
 
 
1204 aa  97.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.05 
 
 
1328 aa  91.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  28.06 
 
 
1748 aa  91.3  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  29.39 
 
 
925 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  25.12 
 
 
1223 aa  90.5  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3479  KP-43 peptidase  24.06 
 
 
697 aa  87.8  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.77 
 
 
835 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000302047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.94 
 
 
1234 aa  82.8  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  26.32 
 
 
1613 aa  78.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.43 
 
 
1016 aa  77  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.62 
 
 
509 aa  69.3  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.07 
 
 
2182 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  28.86 
 
 
1239 aa  62.4  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0085  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.9 
 
 
866 aa  60.1  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.79 
 
 
2171 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.72 
 
 
1106 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.14 
 
 
576 aa  57  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1811  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.24 
 
 
618 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.87 
 
 
1253 aa  54.7  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4652  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.21 
 
 
986 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0586324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1604  hypothetical protein  32.89 
 
 
531 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103561  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.7 
 
 
632 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.473646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  26.72 
 
 
1285 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1650  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.28 
 
 
557 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.920736  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.02 
 
 
1052 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.32 
 
 
1234 aa  51.6  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.242964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.21 
 
 
997 aa  51.2  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0362893  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.74 
 
 
1205 aa  50.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1121 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4630  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.16 
 
 
1405 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.82 
 
 
1172 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  27.59 
 
 
644 aa  48.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2389  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.88 
 
 
533 aa  48.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.377717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.14 
 
 
1124 aa  47.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.56 
 
 
396 aa  47.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1576  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.73 
 
 
559 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
1086 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.92 
 
 
1078 aa  46.2  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8381  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  23.87 
 
 
410 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.88 
 
 
626 aa  45.8  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0023  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.53 
 
 
1008 aa  45.8  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.421595  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1878  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.71 
 
 
451 aa  45.8  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.597803  normal  0.61636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1890  cell surface protein  32.29 
 
 
671 aa  45.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.642058  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.03 
 
 
640 aa  45.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1224  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.85 
 
 
458 aa  44.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000763624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.75 
 
 
915 aa  44.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1004  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.12 
 
 
396 aa  44.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.774887  normal  0.176655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>