76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1878 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1878  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
451 aa  885    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.597803  normal  0.61636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3412  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  73.17 
 
 
453 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1137  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.42 
 
 
454 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0066  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.81 
 
 
491 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  27.08 
 
 
644 aa  70.5  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.13 
 
 
509 aa  66.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4009  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
662 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.64 
 
 
699 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 
1121 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5487  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.48 
 
 
671 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153721  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.16 
 
 
392 aa  54.7  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  29.51 
 
 
1324 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.91 
 
 
1205 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1224  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.8 
 
 
458 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000763624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  26.41 
 
 
399 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1604  hypothetical protein  33.66 
 
 
531 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103561  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  27.05 
 
 
1351 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4652  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.34 
 
 
986 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0586324  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1388  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.92 
 
 
444 aa  50.4  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.196735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1574  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.83 
 
 
560 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.266875  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.33 
 
 
625 aa  50.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.83 
 
 
746 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4620  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  37.18 
 
 
421 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0849966  hitchhiker  0.0030964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1004  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.62 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.774887  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.17 
 
 
640 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2081  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.78 
 
 
848 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  37.4 
 
 
1056 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  28.03 
 
 
533 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5026  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.2 
 
 
426 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  22.88 
 
 
297 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.93 
 
 
396 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.37 
 
 
520 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.09 
 
 
805 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.79 
 
 
463 aa  47.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.92 
 
 
1054 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.38 
 
 
612 aa  47  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1890  cell surface protein  32.56 
 
 
671 aa  46.6  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.642058  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1086  intracellular serine protease  27.14 
 
 
339 aa  47  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  26.67 
 
 
2552 aa  46.6  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2494  cell surface protein  39.58 
 
 
462 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.909338  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1788  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.59 
 
 
635 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0198  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  24.01 
 
 
298 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.32 
 
 
819 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0298  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.47 
 
 
320 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.57 
 
 
823 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.32 
 
 
819 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2389  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.41 
 
 
533 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.377717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.32 
 
 
809 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.78 
 
 
587 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4242  hypothetical protein  25.71 
 
 
903 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1151  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.93 
 
 
449 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0797814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.32 
 
 
819 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.32 
 
 
819 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.78 
 
 
587 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1573  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.17 
 
 
559 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.32 
 
 
805 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2208  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.37 
 
 
605 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00762588  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.32 
 
 
805 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  23.93 
 
 
298 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  41.18 
 
 
514 aa  44.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  27.68 
 
 
1285 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3892  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.55 
 
 
295 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000195035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0213  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.79 
 
 
428 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0291  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.72 
 
 
320 aa  44.3  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  28.44 
 
 
1239 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1576  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.24 
 
 
559 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.15 
 
 
682 aa  43.9  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2745  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.38 
 
 
521 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000278512  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2168  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.29 
 
 
586 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828651  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.09 
 
 
997 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0362893  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04360  subtilisin-like serine protease  27.67 
 
 
531 aa  43.1  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1681  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.3 
 
 
450 aa  43.1  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  25.07 
 
 
942 aa  43.1  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2570  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.38 
 
 
521 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2637  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.38 
 
 
521 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000344019  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>