59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2168 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2168  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 		 586 aa  1195    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1645  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  72.89 
 
 		 590 aa  858    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.501678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4113  hypothetical protein  65.44 
 
 		 569 aa  733    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  65.79 
 
 		 569 aa  739    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.158327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4152  hypothetical protein  72.62 
 
 		 590 aa  866    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48170  hypothetical protein  72.18 
 
 		 590 aa  863    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851299  normal  0.0420859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1876  hypothetical protein  42.04 
 
 		 588 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.869311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  22.36 
 
 		 495 aa  57  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.75 
 
 		 658 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  28.21 
 
 		 497 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.76 
 
 		 453 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.22 
 
 		 576 aa  52.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2709  serine metalloprotease  27.86 
 
 		 497 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  23.21 
 
 		 576 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1101  serine metalloprotease  27.86 
 
 		 500 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0573282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  32.43 
 
 		 840 aa  51.2  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.44 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.92 
 
 		 639 aa  48.5  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1770  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.52 
 
 		 527 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26 
 
 		 682 aa  48.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.3 
 
 		 710 aa  48.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.3 
 
 		 1054 aa  48.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.54 
 
 		 995 aa  47.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.64 
 
 		 648 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.66 
 
 		 327 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2485  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.64 
 
 		 650 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.5 
 
 		 465 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3136  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.79 
 
 		 375 aa  47.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05875  Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin  25.19 
 
 		 956 aa  47.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2081  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.84 
 
 		 848 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1417  serine metalloprotease MrpA  29.34 
 
 		 560 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.56 
 
 		 693 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1343  putative serine metalloprotease  27.76 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1426  putative serine metalloprotease  27.76 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.94 
 
 		 1205 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.51 
 
 		 680 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3598  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.93 
 
 		 586 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.799906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.98 
 
 		 625 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.49 
 
 		 612 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2585  peptidase  27.76 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  24.04 
 
 		 790 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1248  serine metalloprotease MrpA  27.76 
 
 		 539 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.49 
 
 		 587 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1078  serine metalloprotease MrpA  27.76 
 
 		 539 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.673556  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0493  serine metalloprotease MrpA  27.76 
 
 		 539 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179342  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0221  serine metalloprotease MrpA  27.76 
 
 		 539 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  25.08 
 
 		 1033 aa  45.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6573  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.28 
 
 		 492 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.07 
 
 		 835 aa  45.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1626  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.46 
 
 		 432 aa  45.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4009  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.83 
 
 		 662 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0795  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.98 
 
 		 442 aa  44.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.746583  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26 
 
 		 479 aa  44.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  31.71 
 
 		 2911 aa  44.3  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0379  serine metalloprotease precursor  26.79 
 
 		 502 aa  43.9  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764372  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.32 
 
 		 555 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.1109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.97 
 
 		 835 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.78 
 
 		 578 aa  43.9  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0383041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.15 
 
 		 1085 aa  43.5  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>