46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4113 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4113  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1154    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2168  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  64.72 
 
 		 586 aa  712    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4152  hypothetical protein  66.78 
 
 		 590 aa  746    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48170  hypothetical protein  67.01 
 
 		 590 aa  754    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851299  normal  0.0420859 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  97.01 
 
 		 569 aa  1095    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.158327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1645  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  67.79 
 
 		 590 aa  752    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.501678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1876  hypothetical protein  42.81 
 
 		 588 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.869311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.15 
 
 		 680 aa  60.1  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.83 
 
 		 487 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.16 
 
 		 658 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.27 
 
 		 452 aa  55.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2140  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.67 
 
 		 703 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.79 
 
 		 1205 aa  54.3  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  25.17 
 
 		 1033 aa  53.9  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.98 
 
 		 995 aa  52.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  22.41 
 
 		 576 aa  50.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 		 576 aa  51.2  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.01 
 
 		 453 aa  50.8  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.53 
 
 		 1052 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05875  Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin  25.63 
 
 		 956 aa  50.4  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.07 
 
 		 327 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.23 
 
 		 639 aa  48.9  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0795  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.83 
 
 		 442 aa  48.5  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.746583  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.76 
 
 		 495 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.33 
 
 		 693 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  30.08 
 
 		 485 aa  47.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  33.33 
 
 		 917 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.91 
 
 		 490 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  30.34 
 
 		 840 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  32.46 
 
 		 917 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0341  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.63 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.835088 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  32.46 
 
 		 917 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.89 
 
 		 682 aa  46.2  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 		 1029 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  23.21 
 
 		 298 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  32.46 
 
 		 917 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  23.49 
 
 		 298 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  31.78 
 
 		 917 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  31.78 
 
 		 917 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.58 
 
 		 915 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.66 
 
 		 836 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  31.78 
 
 		 917 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  31.78 
 
 		 917 aa  44.3  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.96 
 
 		 517 aa  43.9  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000329781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  26.43 
 
 		 497 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6261  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.02 
 
 		 427 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>