39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4152 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2168  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  72.62 
 
 
586 aa  842    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828651  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4152  hypothetical protein  100 
 
 
590 aa  1176    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  67.89 
 
 
569 aa  750    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.158327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1645  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  77.13 
 
 
590 aa  918    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.501678  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48170  hypothetical protein  92.71 
 
 
590 aa  1095    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851299  normal  0.0420859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4113  hypothetical protein  67.89 
 
 
569 aa  745    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233114  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1876  hypothetical protein  43.01 
 
 
588 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.869311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.1 
 
 
658 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239994  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2709  serine metalloprotease  28.16 
 
 
497 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1101  serine metalloprotease  28.16 
 
 
500 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0573282  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  27.8 
 
 
497 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.82 
 
 
1205 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.69 
 
 
487 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.87 
 
 
612 aa  51.2  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0379  serine metalloprotease precursor  27.08 
 
 
502 aa  51.2  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.83 
 
 
453 aa  51.2  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.57 
 
 
576 aa  50.8  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  23.75 
 
 
495 aa  50.4  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  27.96 
 
 
840 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.09 
 
 
639 aa  48.9  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  61.11 
 
 
693 aa  48.9  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.51 
 
 
465 aa  48.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.5 
 
 
327 aa  47.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.34 
 
 
995 aa  47.8  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.27 
 
 
517 aa  47.4  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000329781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.25 
 
 
490 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2140  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.39 
 
 
703 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.03 
 
 
682 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.97 
 
 
835 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4009  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.01 
 
 
662 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.97 
 
 
835 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0257  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.16 
 
 
449 aa  44.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  24.74 
 
 
1033 aa  44.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0261  hypothetical protein  38.98 
 
 
688 aa  44.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.194393 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.34 
 
 
452 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  24.91 
 
 
1096 aa  43.9  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0341  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.33 
 
 
627 aa  43.9  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.835088 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05576  serine proteinase  25.22 
 
 
592 aa  43.9  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3598  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.53 
 
 
586 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.799906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>