14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1876 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1876  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1193    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.869311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1645  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.67 
 
 		 590 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.501678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48170  hypothetical protein  43.7 
 
 		 590 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851299  normal  0.0420859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4152  hypothetical protein  43.01 
 
 		 590 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2168  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.35 
 
 		 586 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4113  hypothetical protein  43.37 
 
 		 569 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.19 
 
 		 569 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.158327 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.32 
 
 		 710 aa  56.2  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.53 
 
 		 648 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0995  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  41.25 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.59 
 
 		 693 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2485  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.48 
 
 		 650 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.53 
 
 		 636 aa  44.3  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.382458 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.17 
 
 		 1205 aa  43.5  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>