34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1645 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2168  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  72.63 
 
 		 586 aa  841    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48170  hypothetical protein  77.85 
 
 		 590 aa  943    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851299  normal  0.0420859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1645  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 		 590 aa  1201    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.501678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4113  hypothetical protein  67.49 
 
 		 569 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  68.37 
 
 		 569 aa  765    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.158327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4152  hypothetical protein  77.13 
 
 		 590 aa  927    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1876  hypothetical protein  42.78 
 
 		 588 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.869311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.93 
 
 		 658 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0261  hypothetical protein  37.14 
 
 		 688 aa  52  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.194393 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  25.72 
 
 		 497 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1101  serine metalloprotease  25 
 
 		 500 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0573282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.5 
 
 		 639 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2709  serine metalloprotease  25 
 
 		 497 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.83 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.33 
 
 		 693 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  31.29 
 
 		 840 aa  48.5  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.83 
 
 		 487 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.08 
 
 		 452 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.79 
 
 		 1205 aa  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.86 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 		 327 aa  47.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  26.79 
 
 		 513 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12480  subtilisin-like serine protease  26.06 
 
 		 478 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.998475 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  25.44 
 
 		 1096 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.94 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.15 
 
 		 495 aa  47  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  26.39 
 
 		 790 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2140  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.54 
 
 		 703 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.3 
 
 		 465 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.18 
 
 		 517 aa  44.3  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000329781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0379  serine metalloprotease precursor  24.54 
 
 		 502 aa  44.3  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764372  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0257  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.27 
 
 		 449 aa  43.9  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.71 
 
 		 466 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.471806  normal  0.498219 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  22.71 
 
 		 2911 aa  43.9  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>