33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1751 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4113  hypothetical protein  97.01 
 
 
569 aa  1095    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233114  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2168  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  65.06 
 
 
586 aa  716    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828651  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4152  hypothetical protein  67.01 
 
 
590 aa  750    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
569 aa  1152    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.158327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1645  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  68.67 
 
 
590 aa  764    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.501678  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48170  hypothetical protein  67.18 
 
 
590 aa  760    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851299  normal  0.0420859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1876  hypothetical protein  42.76 
 
 
588 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.869311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.15 
 
 
680 aa  58.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.83 
 
 
487 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.16 
 
 
658 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239994  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.79 
 
 
1205 aa  53.9  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.27 
 
 
452 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  23.9 
 
 
1033 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2140  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.29 
 
 
703 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  23.08 
 
 
576 aa  50.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  23.38 
 
 
495 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.59 
 
 
995 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.07 
 
 
327 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.42 
 
 
576 aa  49.3  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05875  Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin  25.63 
 
 
956 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.72 
 
 
639 aa  48.9  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.53 
 
 
1052 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.97 
 
 
453 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0795  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.83 
 
 
442 aa  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.746583  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.33 
 
 
693 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  30.89 
 
 
485 aa  47.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.1 
 
 
298 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  30.34 
 
 
840 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  23.83 
 
 
298 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.91 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.19 
 
 
682 aa  47  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0341  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.63 
 
 
627 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.835088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  32.46 
 
 
917 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>