50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48170 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4113  hypothetical protein  68.13 
 
 
569 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233114  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2168  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  72.18 
 
 
586 aa  839    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828651  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4152  hypothetical protein  92.71 
 
 
590 aa  1095    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  68.3 
 
 
569 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.158327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1645  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  77.85 
 
 
590 aa  929    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.501678  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48170  hypothetical protein  100 
 
 
590 aa  1179    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851299  normal  0.0420859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1876  hypothetical protein  43.7 
 
 
588 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.869311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.4 
 
 
658 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239994  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  34.01 
 
 
840 aa  56.6  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.32 
 
 
453 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  23.75 
 
 
495 aa  54.7  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.98 
 
 
487 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.83 
 
 
1205 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.65 
 
 
576 aa  52.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.95 
 
 
517 aa  51.6  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000329781  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12480  subtilisin-like serine protease  26.33 
 
 
478 aa  50.8  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.998475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.31 
 
 
465 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.45 
 
 
718 aa  50.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  25 
 
 
1096 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.32 
 
 
452 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  61.11 
 
 
693 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
648 aa  48.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0261  hypothetical protein  37.14 
 
 
688 aa  47.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.194393 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  26.98 
 
 
497 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.99 
 
 
540 aa  47.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.1 
 
 
327 aa  47.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2140  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.42 
 
 
703 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1101  serine metalloprotease  26.62 
 
 
500 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0573282  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.71 
 
 
710 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.23 
 
 
639 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.24 
 
 
680 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2709  serine metalloprotease  26.98 
 
 
497 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.25 
 
 
995 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4009  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.08 
 
 
662 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.19 
 
 
612 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.61 
 
 
490 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0795  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.92 
 
 
442 aa  45.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.746583  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3479  KP-43 peptidase  24.08 
 
 
697 aa  44.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4488  proprotein convertase P  24.46 
 
 
592 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  25.86 
 
 
1033 aa  45.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3136  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.24 
 
 
375 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  24.38 
 
 
576 aa  44.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3716  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.83 
 
 
524 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.82 
 
 
555 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.1109 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  26.81 
 
 
298 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.81 
 
 
298 aa  43.9  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1770  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.59 
 
 
527 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0341  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.16 
 
 
627 aa  43.9  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.835088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3598  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.53 
 
 
586 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.799906  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  30.16 
 
 
2552 aa  43.5  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>