More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2891 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2654  serine protease protein  60.48 
 
 
679 aa  696    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2485  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  97.01 
 
 
650 aa  1134    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
648 aa  1268    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0379  serine metalloprotease precursor  42.96 
 
 
502 aa  279  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2484  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.67 
 
 
547 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2890  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.67 
 
 
547 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2709  serine metalloprotease  42.96 
 
 
497 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1101  serine metalloprotease  42.96 
 
 
500 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0573282  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1417  serine metalloprotease MrpA  39.1 
 
 
560 aa  259  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620558  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  42.49 
 
 
497 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2585  peptidase  38.7 
 
 
563 aa  257  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1343  putative serine metalloprotease  38.7 
 
 
563 aa  257  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1426  putative serine metalloprotease  38.7 
 
 
563 aa  257  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23258  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2653  putative extracellular protease signal peptide protein  38.73 
 
 
543 aa  256  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1248  serine metalloprotease MrpA  38.49 
 
 
539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1078  serine metalloprotease MrpA  38.49 
 
 
539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.673556  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0221  serine metalloprotease MrpA  38.49 
 
 
539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0493  serine metalloprotease MrpA  38.49 
 
 
539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179342  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1032  peptidase MprA  38.92 
 
 
555 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.24 
 
 
552 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5741  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.24 
 
 
552 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0530598  normal  0.287024 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4563  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.24 
 
 
552 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0340  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.04 
 
 
624 aa  243  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0341  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.16 
 
 
627 aa  243  7.999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.835088 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1283  peptidase MprA  39.96 
 
 
550 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.14 
 
 
555 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.923293  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3992  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.35 
 
 
555 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355487  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04562  extracellular protease  37.68 
 
 
454 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  35.85 
 
 
641 aa  235  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0996  peptidase MprA  40.68 
 
 
540 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.526274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  40.33 
 
 
560 aa  233  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4080  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.55 
 
 
549 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.31 
 
 
651 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.09 
 
 
579 aa  223  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.92 
 
 
636 aa  222  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.382458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.94 
 
 
617 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3184  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.98 
 
 
1687 aa  212  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5741  serine protease, subtilase family  40.41 
 
 
564 aa  211  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.77 
 
 
498 aa  206  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.35 
 
 
693 aa  204  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2704  serine protease  36.44 
 
 
564 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0794852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2882  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.71 
 
 
939 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03059  protease  36.18 
 
 
620 aa  184  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0261  hypothetical protein  30 
 
 
688 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.194393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1582  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.53 
 
 
501 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39.62 
 
 
771 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0245  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.96 
 
 
882 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.983074  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0234  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.45 
 
 
852 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.89 
 
 
724 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0256  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.05 
 
 
868 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.93 
 
 
721 aa  154  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.42 
 
 
754 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234127  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2001  hypothetical protein  29.65 
 
 
562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.05 
 
 
587 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1996  hypothetical protein  29.22 
 
 
562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.78 
 
 
615 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.66 
 
 
797 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.19 
 
 
557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0457  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.25 
 
 
394 aa  127  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.98 
 
 
615 aa  124  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.17 
 
 
601 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.27 
 
 
589 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1096  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.27 
 
 
589 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.93 
 
 
595 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.63 
 
 
653 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.17 
 
 
639 aa  110  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1379  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.4 
 
 
641 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863708  normal  0.0771449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5496  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.1 
 
 
635 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.252703 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0553  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.44 
 
 
440 aa  103  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000105969  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.73 
 
 
298 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02673  extracellular protease  44.93 
 
 
170 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2796  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.34 
 
 
856 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  31.41 
 
 
298 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.01 
 
 
399 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116357  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4164  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.82 
 
 
575 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  28.75 
 
 
397 aa  97.8  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  28.75 
 
 
397 aa  97.8  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  28.75 
 
 
397 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  28.75 
 
 
397 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  28.75 
 
 
397 aa  97.8  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
453 aa  97.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.61 
 
 
583 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.96 
 
 
397 aa  96.3  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3334  hypothetical protein  29.46 
 
 
464 aa  95.1  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261998  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  28.5 
 
 
397 aa  94  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  28.5 
 
 
397 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  28.5 
 
 
397 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.95 
 
 
415 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  28.5 
 
 
397 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.67 
 
 
423 aa  92.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.53 
 
 
479 aa  91.3  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.24 
 
 
1383 aa  90.5  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.74 
 
 
577 aa  89.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.41 
 
 
695 aa  89.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.397148  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.82 
 
 
452 aa  89  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.87 
 
 
510 aa  87  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.2 
 
 
639 aa  87  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.79 
 
 
1054 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.34 
 
 
680 aa  87  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.08 
 
 
540 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>