More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2890 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2653  putative extracellular protease signal peptide protein  77.89 
 
 
543 aa  721    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2890  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
547 aa  1080    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2484  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  97.8 
 
 
547 aa  987    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1032  peptidase MprA  49.11 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0996  peptidase MprA  50.11 
 
 
540 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.526274 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5741  serine protease, subtilase family  45.68 
 
 
564 aa  324  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2585  peptidase  42.21 
 
 
563 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1426  putative serine metalloprotease  42.21 
 
 
563 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23258  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1343  putative serine metalloprotease  42.21 
 
 
563 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1248  serine metalloprotease MrpA  42.21 
 
 
539 aa  280  7e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1078  serine metalloprotease MrpA  42.21 
 
 
539 aa  280  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.673556  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0493  serine metalloprotease MrpA  42.21 
 
 
539 aa  280  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179342  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0221  serine metalloprotease MrpA  42.21 
 
 
539 aa  280  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0379  serine metalloprotease precursor  41.51 
 
 
502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1417  serine metalloprotease MrpA  42.82 
 
 
560 aa  273  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620558  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.61 
 
 
555 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.923293  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2654  serine protease protein  36.65 
 
 
679 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3992  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.5 
 
 
555 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355487  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.96 
 
 
693 aa  263  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2485  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.09 
 
 
650 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.9 
 
 
648 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1283  peptidase MprA  41.09 
 
 
550 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5741  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.47 
 
 
552 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0530598  normal  0.287024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.47 
 
 
552 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4563  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.47 
 
 
552 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2709  serine metalloprotease  41.84 
 
 
497 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1101  serine metalloprotease  41.84 
 
 
500 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0573282  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  40.86 
 
 
497 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0261  hypothetical protein  37.4 
 
 
688 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.194393 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4080  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.05 
 
 
549 aa  243  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.46 
 
 
579 aa  240  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0341  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.97 
 
 
627 aa  239  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.835088 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  35.97 
 
 
560 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04562  extracellular protease  37.28 
 
 
454 aa  227  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1582  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.68 
 
 
501 aa  220  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.28 
 
 
651 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.38 
 
 
617 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.96 
 
 
724 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.23 
 
 
636 aa  213  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.382458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  35.21 
 
 
771 aa  210  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0340  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.19 
 
 
624 aa  209  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.4 
 
 
498 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.47 
 
 
721 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  36.53 
 
 
641 aa  201  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.69 
 
 
754 aa  199  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234127  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2704  serine protease  34.18 
 
 
564 aa  194  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0794852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2882  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.95 
 
 
939 aa  190  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03059  protease  34.75 
 
 
620 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3184  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.87 
 
 
1687 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0457  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.25 
 
 
394 aa  158  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0245  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.94 
 
 
882 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.983074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0256  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.64 
 
 
868 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0234  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.55 
 
 
852 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.68 
 
 
601 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.31 
 
 
587 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.04 
 
 
797 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.81 
 
 
577 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.07 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.16 
 
 
587 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.76 
 
 
595 aa  113  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.65 
 
 
653 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.26 
 
 
626 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.04 
 
 
583 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02673  extracellular protease  46.32 
 
 
170 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2001  hypothetical protein  27.29 
 
 
562 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.89 
 
 
589 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1096  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.89 
 
 
589 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.61 
 
 
638 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  29.26 
 
 
576 aa  107  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1996  hypothetical protein  27.06 
 
 
562 aa  107  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.5 
 
 
615 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.45 
 
 
557 aa  106  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2796  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.5 
 
 
856 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.74 
 
 
615 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.42 
 
 
612 aa  103  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.47 
 
 
1158 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4164  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.65 
 
 
575 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.99 
 
 
452 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.69 
 
 
397 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.72 
 
 
626 aa  99.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.61 
 
 
597 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1379  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.91 
 
 
641 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863708  normal  0.0771449 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.06 
 
 
695 aa  99  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.397148  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.27 
 
 
399 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116357  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.25 
 
 
639 aa  98.2  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.19 
 
 
692 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.33 
 
 
415 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5496  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 
635 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.252703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.16 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  26.5 
 
 
397 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  26.5 
 
 
397 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  26.5 
 
 
397 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  28.19 
 
 
606 aa  92  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  26.5 
 
 
397 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  27.4 
 
 
397 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  26.5 
 
 
397 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.88 
 
 
1383 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.13 
 
 
669 aa  91.3  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  27.05 
 
 
397 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  26.78 
 
 
397 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>