More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0340 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0341  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  66.17 
 
 
627 aa  724    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.835088 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0340  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
624 aa  1224    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  44.58 
 
 
641 aa  391  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0379  serine metalloprotease precursor  55.28 
 
 
502 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.27 
 
 
651 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  51.95 
 
 
560 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1101  serine metalloprotease  55.03 
 
 
500 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0573282  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.24 
 
 
579 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2709  serine metalloprotease  55.03 
 
 
497 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2882  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.88 
 
 
939 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  55.03 
 
 
497 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04562  extracellular protease  47.15 
 
 
454 aa  364  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3184  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.38 
 
 
1687 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1343  putative serine metalloprotease  44.93 
 
 
563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2585  peptidase  44.93 
 
 
563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1426  putative serine metalloprotease  44.93 
 
 
563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23258  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1248  serine metalloprotease MrpA  44.93 
 
 
539 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1078  serine metalloprotease MrpA  44.93 
 
 
539 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.673556  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0221  serine metalloprotease MrpA  44.93 
 
 
539 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0493  serine metalloprotease MrpA  44.93 
 
 
539 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179342  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.75 
 
 
617 aa  336  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1417  serine metalloprotease MrpA  45.48 
 
 
560 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620558  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1283  peptidase MprA  48.01 
 
 
550 aa  331  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.74 
 
 
636 aa  329  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.382458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03059  protease  45.45 
 
 
620 aa  325  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3992  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.44 
 
 
555 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355487  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.44 
 
 
555 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.923293  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5741  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.9 
 
 
552 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0530598  normal  0.287024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.9 
 
 
552 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4563  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.9 
 
 
552 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4080  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.86 
 
 
549 aa  306  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2654  serine protease protein  40 
 
 
679 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  43.85 
 
 
771 aa  291  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.96 
 
 
693 aa  284  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.84 
 
 
724 aa  275  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2485  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.97 
 
 
650 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.74 
 
 
648 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.28 
 
 
498 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  40.08 
 
 
721 aa  267  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2704  serine protease  39.92 
 
 
564 aa  266  7e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0794852  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1582  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.57 
 
 
501 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1032  peptidase MprA  41.61 
 
 
555 aa  261  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0234  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.44 
 
 
852 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.09 
 
 
754 aa  247  6e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234127  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0245  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.48 
 
 
882 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.983074  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0261  hypothetical protein  39.7 
 
 
688 aa  242  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.194393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0256  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.97 
 
 
868 aa  240  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0996  peptidase MprA  43.01 
 
 
540 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.526274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2484  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.25 
 
 
547 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5741  serine protease, subtilase family  42.79 
 
 
564 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2890  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.04 
 
 
547 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2653  putative extracellular protease signal peptide protein  37.58 
 
 
543 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.96 
 
 
587 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.29 
 
 
557 aa  204  4e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1096  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.21 
 
 
589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.21 
 
 
589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2001  hypothetical protein  34.74 
 
 
562 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.02 
 
 
797 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1996  hypothetical protein  34.32 
 
 
562 aa  193  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.11 
 
 
601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  40.65 
 
 
615 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0457  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.94 
 
 
394 aa  181  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.07 
 
 
583 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.16 
 
 
615 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32 
 
 
653 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.01 
 
 
595 aa  175  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.16 
 
 
577 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.71 
 
 
639 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.66 
 
 
399 aa  164  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  35.55 
 
 
397 aa  163  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  35.55 
 
 
397 aa  163  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.63 
 
 
587 aa  163  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  35.55 
 
 
397 aa  163  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  35.55 
 
 
397 aa  163  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  35.55 
 
 
397 aa  163  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  35.55 
 
 
397 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.67 
 
 
612 aa  162  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.71 
 
 
587 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0553  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.67 
 
 
440 aa  162  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000105969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5496  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.72 
 
 
635 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.252703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  35.55 
 
 
397 aa  162  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  35.26 
 
 
397 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  35.36 
 
 
397 aa  160  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02673  extracellular protease  61.76 
 
 
170 aa  158  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.06 
 
 
1085 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.18 
 
 
1054 aa  153  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.73 
 
 
397 aa  153  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2156  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.08 
 
 
401 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2796  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.79 
 
 
856 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.23 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.75 
 
 
692 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  32.19 
 
 
606 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  30.5 
 
 
606 aa  148  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  37.72 
 
 
1096 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.19 
 
 
1383 aa  144  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.51 
 
 
638 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.68 
 
 
625 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.58 
 
 
452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0486  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.42 
 
 
742 aa  142  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.690821  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.66 
 
 
490 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>