More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1368 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 
710 aa  1440    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  44.06 
 
 
4630 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  47.51 
 
 
767 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  43.85 
 
 
629 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  41.45 
 
 
1208 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  41.3 
 
 
685 aa  146  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  42.7 
 
 
625 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  39.89 
 
 
693 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  39.27 
 
 
518 aa  134  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  38.98 
 
 
506 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  40.56 
 
 
920 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  41.04 
 
 
457 aa  127  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  37.08 
 
 
926 aa  127  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  41.44 
 
 
548 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  35.86 
 
 
1821 aa  125  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  36.36 
 
 
526 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  37.5 
 
 
1226 aa  124  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  39.36 
 
 
758 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  34.76 
 
 
820 aa  122  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  36.68 
 
 
1321 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  38.07 
 
 
624 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  38.33 
 
 
1194 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  35.29 
 
 
921 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.03 
 
 
1328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  40.11 
 
 
288 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  34.95 
 
 
218 aa  116  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  37.28 
 
 
1081 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  33.15 
 
 
573 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  39.47 
 
 
631 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  37.08 
 
 
1154 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.48 
 
 
1054 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.43 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 
1174 aa  111  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  36.36 
 
 
1710 aa  111  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  30.39 
 
 
657 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.91 
 
 
2313 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  37.43 
 
 
542 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  35 
 
 
935 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  34.62 
 
 
932 aa  108  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  35.29 
 
 
548 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.64 
 
 
1029 aa  107  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  36.78 
 
 
531 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  33.64 
 
 
1013 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  35.09 
 
 
1847 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  33.33 
 
 
693 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  35.63 
 
 
223 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  34.88 
 
 
1223 aa  105  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.03 
 
 
640 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  34.81 
 
 
748 aa  103  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  34.81 
 
 
1009 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.24 
 
 
1016 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  31.25 
 
 
546 aa  102  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.8 
 
 
995 aa  100  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  32 
 
 
1168 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  33.52 
 
 
506 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  29.32 
 
 
3027 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  32.77 
 
 
756 aa  100  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  37.08 
 
 
286 aa  99.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  29.79 
 
 
414 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  29.95 
 
 
431 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  33.87 
 
 
530 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.76 
 
 
447 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  31.88 
 
 
880 aa  97.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.88 
 
 
1231 aa  96.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  32.2 
 
 
604 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  28.12 
 
 
413 aa  95.5  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  33.72 
 
 
914 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  30.81 
 
 
1260 aa  95.1  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  30.27 
 
 
375 aa  94.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  32 
 
 
554 aa  94.7  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.49 
 
 
1661 aa  94.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.44 
 
 
1234 aa  93.6  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  32.2 
 
 
618 aa  93.6  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  29.89 
 
 
669 aa  94  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  25.82 
 
 
546 aa  94  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  30.96 
 
 
660 aa  93.6  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  32.76 
 
 
939 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  35.16 
 
 
822 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.73 
 
 
410 aa  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.73 
 
 
410 aa  92  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.12 
 
 
410 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  30.48 
 
 
552 aa  91.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.73 
 
 
410 aa  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  31.61 
 
 
807 aa  90.9  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  31.61 
 
 
521 aa  90.5  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  31.25 
 
 
410 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  30.05 
 
 
413 aa  90.1  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  31.89 
 
 
396 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.79 
 
 
688 aa  88.6  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  35.43 
 
 
692 aa  87.8  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 
524 aa  87.8  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  30.11 
 
 
834 aa  87.4  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  32.37 
 
 
257 aa  87.4  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.96 
 
 
567 aa  87.4  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
533 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
533 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  30.56 
 
 
1457 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  32.95 
 
 
410 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.15 
 
 
539 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000635651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  35.03 
 
 
859 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>