More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1208 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 1048 aa  2126    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  64.42 
 
 		 981 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  39.49 
 
 		 460 aa  321  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  32.03 
 
 		 459 aa  239  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  31.25 
 
 		 459 aa  205  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  30.32 
 
 		 467 aa  197  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  31.89 
 
 		 463 aa  164  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  27.17 
 
 		 478 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  56.65 
 
 		 1821 aa  160  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  32.66 
 
 		 434 aa  159  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  27.52 
 
 		 450 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  43.5 
 
 		 1009 aa  135  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  33.16 
 
 		 426 aa  134  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  34.28 
 
 		 4630 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  30.85 
 
 		 1300 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  51.59 
 
 		 437 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 		 422 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  24.37 
 
 		 422 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.15 
 
 		 511 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  27.49 
 
 		 510 aa  114  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  30.23 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  40.37 
 
 		 220 aa  101  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  31.77 
 
 		 635 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  28.9 
 
 		 499 aa  99  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  25.33 
 
 		 674 aa  98.6  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  27.12 
 
 		 479 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  27.3 
 
 		 459 aa  96.3  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  27.12 
 
 		 479 aa  94.7  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  27.18 
 
 		 560 aa  94  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  24.41 
 
 		 728 aa  94  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  31.16 
 
 		 551 aa  94.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  29.18 
 
 		 1361 aa  92.8  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  25.13 
 
 		 576 aa  92.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  40.61 
 
 		 1937 aa  91.7  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  25.52 
 
 		 563 aa  91.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  40.61 
 
 		 1467 aa  91.7  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  30.93 
 
 		 568 aa  91.3  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  32 
 
 		 1109 aa  91.3  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  26.55 
 
 		 524 aa  90.9  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  28.9 
 
 		 2042 aa  90.1  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  29.95 
 
 		 815 aa  89.4  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  29.13 
 
 		 555 aa  89.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  31 
 
 		 1142 aa  89.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  25.13 
 
 		 477 aa  89.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  30.62 
 
 		 1131 aa  89  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  30.5 
 
 		 1088 aa  88.6  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1119  endo-beta-galactosidase, GlcNAc-alpha-1,4-Gal-releasing  34.6 
 
 		 420 aa  88.6  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.308798  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  30.62 
 
 		 1131 aa  89  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  30.62 
 
 		 1131 aa  89  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  30.62 
 
 		 1131 aa  89  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  30.62 
 
 		 1131 aa  89  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  30.62 
 
 		 1131 aa  89  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 		 1138 aa  88.2  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  28.86 
 
 		 563 aa  88.2  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  41.67 
 
 		 1093 aa  87.4  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  31 
 
 		 1137 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  31 
 
 		 1137 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 552 aa  87  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  31 
 
 		 1137 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.91 
 
 		 515 aa  87.4  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  29.9 
 
 		 551 aa  87  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  27.72 
 
 		 571 aa  87  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  29.9 
 
 		 600 aa  87  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  29.9 
 
 		 582 aa  87  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  28.14 
 
 		 562 aa  87  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  48.17 
 
 		 688 aa  86.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  48.89 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  27.98 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  29.9 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  29.9 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  29.53 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  30.26 
 
 		 567 aa  85.5  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  29.73 
 
 		 1137 aa  85.9  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  30.5 
 
 		 1088 aa  85.9  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  30.77 
 
 		 575 aa  85.5  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  28.7 
 
 		 557 aa  85.9  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  26.52 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  29.73 
 
 		 1137 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  30.5 
 
 		 1088 aa  85.9  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  38.55 
 
 		 570 aa  85.9  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  39.81 
 
 		 1093 aa  85.1  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 556 aa  85.1  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  26.92 
 
 		 1279 aa  85.1  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  30.57 
 
 		 572 aa  85.1  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  29.5 
 
 		 1092 aa  85.1  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  31 
 
 		 1106 aa  84.7  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  31 
 
 		 1106 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  30.5 
 
 		 1108 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  29.67 
 
 		 878 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  38.89 
 
 		 1110 aa  84.3  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  26.88 
 
 		 560 aa  84.3  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  40.74 
 
 		 1106 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  28.14 
 
 		 563 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  29 
 
 		 1154 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  31.11 
 
 		 529 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  40.12 
 
 		 1421 aa  84.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  23.32 
 
 		 590 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  30.5 
 
 		 1113 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  30.5 
 
 		 1136 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  39.81 
 
 		 1108 aa  83.2  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>