More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0303 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  65.23 
 
 
600 aa  741    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  59.78 
 
 
582 aa  696    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
557 aa  1139    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  51.04 
 
 
562 aa  543  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  50.66 
 
 
562 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  50.38 
 
 
557 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  48.67 
 
 
559 aa  536  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  49.05 
 
 
558 aa  531  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  48.31 
 
 
558 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  48.5 
 
 
558 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  49.05 
 
 
558 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  48.86 
 
 
558 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  49.05 
 
 
558 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  48.78 
 
 
558 aa  528  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  49.05 
 
 
558 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  53.4 
 
 
570 aa  528  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  48.03 
 
 
558 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  48.98 
 
 
571 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  47.83 
 
 
558 aa  519  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  47.78 
 
 
563 aa  514  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  46.8 
 
 
554 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  49.62 
 
 
572 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  46.33 
 
 
554 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2575  alpha amylase catalytic region  46.01 
 
 
604 aa  485  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.260702  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  45.82 
 
 
551 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  44.73 
 
 
538 aa  482  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  45.13 
 
 
568 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  45.53 
 
 
554 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  45.22 
 
 
554 aa  475  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  46.2 
 
 
556 aa  477  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.5 
 
 
560 aa  478  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  47.67 
 
 
556 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  47.35 
 
 
555 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.08 
 
 
563 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  45.22 
 
 
554 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  46.17 
 
 
549 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  49.7 
 
 
622 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  46.17 
 
 
549 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  44.94 
 
 
554 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  44.94 
 
 
554 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  45.14 
 
 
554 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  49.28 
 
 
555 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  44.94 
 
 
554 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  44.94 
 
 
554 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  44.83 
 
 
554 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  44.96 
 
 
554 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  43.49 
 
 
566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.18 
 
 
556 aa  467  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  47.28 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  46.65 
 
 
563 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  46.42 
 
 
577 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  45.44 
 
 
590 aa  459  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  44.44 
 
 
560 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  48.76 
 
 
557 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  42.17 
 
 
554 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.02 
 
 
531 aa  456  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.15 
 
 
556 aa  456  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  41.89 
 
 
554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.11 
 
 
561 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  46.46 
 
 
552 aa  451  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.83 
 
 
560 aa  449  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  43.55 
 
 
535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.08 
 
 
562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  44.98 
 
 
606 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  43.94 
 
 
577 aa  441  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  43.73 
 
 
561 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  44.56 
 
 
571 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.36 
 
 
538 aa  437  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.11 
 
 
562 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.24 
 
 
563 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1934  alpha amylase catalytic region  42.54 
 
 
643 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.83 
 
 
553 aa  428  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  43.02 
 
 
553 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.83 
 
 
553 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.91 
 
 
553 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  44.35 
 
 
596 aa  425  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.75 
 
 
553 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  40.97 
 
 
536 aa  426  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.97 
 
 
560 aa  428  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.69 
 
 
561 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04843  Putative alpha-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B3N7]  41.04 
 
 
591 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145231  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  42.64 
 
 
553 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.72 
 
 
554 aa  425  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.25 
 
 
551 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.64 
 
 
553 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.64 
 
 
553 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  43 
 
 
556 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  41.29 
 
 
554 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  44.61 
 
 
639 aa  423  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.45 
 
 
553 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.45 
 
 
553 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  42.94 
 
 
551 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.94 
 
 
551 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.75 
 
 
551 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.94 
 
 
551 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  42.94 
 
 
551 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29292  alpha-D-glucosidase (maltase) ( alpha-amylase) (MALT) (MAZS)  39.81 
 
 
573 aa  414  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370606  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.44 
 
 
551 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42120  alpha-glucosidase maltase  40.97 
 
 
572 aa  415  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.217758  normal  0.25099 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.55 
 
 
551 aa  415  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>