More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3080 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  100 
 
 		 447 aa  903    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  58.22 
 
 		 2313 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  54.21 
 
 		 688 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  39.47 
 
 		 631 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  43.46 
 
 		 857 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  41.26 
 
 		 1853 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  37.42 
 
 		 1710 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  36.94 
 
 		 542 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  37.18 
 
 		 693 aa  99.8  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  36.77 
 
 		 926 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  33.12 
 
 		 1756 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  35.71 
 
 		 685 aa  98.2  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  36.42 
 
 		 1208 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  35.54 
 
 		 935 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  35.26 
 
 		 1321 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  34.62 
 
 		 1081 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  36.59 
 
 		 767 aa  91.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  33.55 
 
 		 531 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  30.12 
 
 		 1821 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  38.22 
 
 		 526 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  34.07 
 
 		 932 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  30.86 
 
 		 920 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  30.06 
 
 		 506 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  31.55 
 
 		 223 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  30.77 
 
 		 573 aa  87.4  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  31.29 
 
 		 1226 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0452  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.42 
 
 		 257 aa  86.7  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  36.54 
 
 		 518 aa  86.3  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.25 
 
 		 1328 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  36.25 
 
 		 758 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  30.97 
 
 		 766 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  35.67 
 
 		 625 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  25.34 
 
 		 693 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  38.22 
 
 		 820 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  32.28 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  31.29 
 
 		 1009 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  37.89 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  33.54 
 
 		 1168 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  38.81 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  38.97 
 
 		 1194 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  34.18 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  38.99 
 
 		 548 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  31.5 
 
 		 546 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  34.21 
 
 		 914 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  34.94 
 
 		 629 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 939 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  33.97 
 
 		 3027 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  33.5 
 
 		 4630 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  30.13 
 
 		 542 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  32.67 
 
 		 1174 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  29.79 
 
 		 760 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  32.7 
 
 		 921 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  30.13 
 
 		 779 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  30.66 
 
 		 765 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  30.5 
 
 		 760 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  35.4 
 
 		 552 aa  80.1  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1184 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  33.97 
 
 		 604 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  36.13 
 
 		 538 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  29.93 
 
 		 755 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.76 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  29.93 
 
 		 766 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  30.66 
 
 		 772 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  37.82 
 
 		 807 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0733  cellulosome anchoring protein cohesin region  31.16 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  31.1 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0045  surface-layer n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase  36.18 
 
 		 531 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000055922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  37.86 
 
 		 624 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.17 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  34.78 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  34.36 
 
 		 710 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0278  S-layer domain protein  33.04 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000762211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  35.77 
 
 		 657 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  35 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  32.45 
 
 		 1421 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  30.46 
 
 		 754 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  32.92 
 
 		 1847 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  31.52 
 
 		 756 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  30.77 
 
 		 935 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  37.82 
 
 		 822 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  27.86 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  36.52 
 
 		 1223 aa  73.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  30.37 
 
 		 527 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1744  S-layer protein  28.93 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000139139  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  34.11 
 
 		 733 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0715  S-layer domain-containing protein  31.62 
 
 		 879 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  32.91 
 
 		 692 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  28.48 
 
 		 536 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  38.24 
 
 		 286 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0903  S-layer protein  31.25 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949153  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  28.96 
 
 		 220 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  28.96 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  27.21 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  34.18 
 
 		 660 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0974  S-layer protein  34.59 
 
 		 819 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000842335 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1787  S-layer protein  29.11 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1926  S-layer protein  29.3 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000888894  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.56 
 
 		 995 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1054  S-layer-like region  34.23 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.44 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>