106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0646 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 349 aa  717    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  45.99 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  36.79 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  37.85 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  36 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  35.08 
 
 		 312 aa  189  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  37.76 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 		 430 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  32.5 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  31 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  30.67 
 
 		 430 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  31 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.84 
 
 		 1115 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  35.81 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  28.96 
 
 		 503 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  31.16 
 
 		 430 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  30.33 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  30.67 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  30.67 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.93 
 
 		 1115 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  31.37 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  31.37 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.84 
 
 		 1119 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  32.47 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  29.9 
 
 		 430 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  30.66 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.9 
 
 		 1115 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  28.98 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.59 
 
 		 1115 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  29.47 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  29.01 
 
 		 428 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  34.56 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  34.93 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  29.51 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  32.54 
 
 		 793 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.69 
 
 		 927 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  30.6 
 
 		 415 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.24 
 
 		 470 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.32 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  28.24 
 
 		 579 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 1101 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  27.86 
 
 		 647 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  29.6 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  27.32 
 
 		 356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 1124 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 567 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 1118 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  31.66 
 
 		 342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  29.6 
 
 		 542 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 		 1154 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  26.25 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 		 583 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  28.96 
 
 		 688 aa  92.8  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  25.61 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2820  hypothetical protein  28.5 
 
 		 822 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59851  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  23.89 
 
 		 521 aa  72.8  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  21.62 
 
 		 1120 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1268  glycosyl hydrolase-like protein  27.57 
 
 		 808 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  25.49 
 
 		 580 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  23.33 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1613  glycosyl hydrolase-like protein  28.44 
 
 		 807 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.5027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.42 
 
 		 872 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  25.93 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  25.84 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3919  chitinase II  23.36 
 
 		 695 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00105192  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  25.94 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  18.47 
 
 		 1002 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00509  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13720)  32.12 
 
 		 1481 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.658967 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  22.22 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  19.78 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  23.02 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  22.55 
 
 		 674 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  23.51 
 
 		 1782 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  25 
 
 		 827 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  22.55 
 
 		 674 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  22.22 
 
 		 674 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  22.22 
 
 		 674 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  22.22 
 
 		 674 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  22.22 
 
 		 674 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  21.9 
 
 		 674 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2210  hypothetical protein  22.52 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.179103  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 		 674 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  22.22 
 
 		 674 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  22.22 
 
 		 674 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  21.67 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  23.91 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  26.77 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 		 541 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  21.9 
 
 		 674 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  21.83 
 
 		 639 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  25.3 
 
 		 772 aa  46.6  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  28.99 
 
 		 1115 aa  46.2  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  22.11 
 
 		 499 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 		 578 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  23.55 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>