181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1652 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 423 aa  861    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  43.74 
 
 		 426 aa  359  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  37.91 
 
 		 428 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  38.08 
 
 		 428 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.32 
 
 		 470 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  35.81 
 
 		 430 aa  265  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  35.58 
 
 		 430 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  35.58 
 
 		 430 aa  263  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  35.58 
 
 		 430 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  35.58 
 
 		 430 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  35.58 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  35.58 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  35.35 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  35.35 
 
 		 430 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  35.35 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  36.21 
 
 		 430 aa  260  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  36.18 
 
 		 420 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  37.03 
 
 		 390 aa  256  7e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  32.41 
 
 		 342 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.13 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  33.2 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  29.51 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  27.21 
 
 		 316 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  29.64 
 
 		 307 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  29.86 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  27.3 
 
 		 384 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  26.23 
 
 		 426 aa  120  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 		 793 aa  117  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  29.35 
 
 		 343 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  24.33 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 356 aa  103  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  28.3 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 418 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.44 
 
 		 1115 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.81 
 
 		 1115 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  30.26 
 
 		 688 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.7 
 
 		 1115 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 		 426 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 		 427 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.7 
 
 		 1119 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  30.04 
 
 		 647 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  23.33 
 
 		 1115 aa  92.8  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  24.42 
 
 		 927 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 583 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  26.32 
 
 		 358 aa  89.7  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 		 567 aa  87.4  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  24.3 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  26.86 
 
 		 579 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  29.61 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 1118 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  25.94 
 
 		 542 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  25.78 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 1154 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 1124 aa  73.2  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  26.69 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  26.41 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  26.44 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2210  hypothetical protein  25.91 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.179103  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  39.81 
 
 		 142 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  33.88 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  34.62 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  37.62 
 
 		 173 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  37.11 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.05 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 		 1101 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.11 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  23.73 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  35.64 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  41.84 
 
 		 303 aa  57  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  42.86 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.4 
 
 		 797 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  39.18 
 
 		 320 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  21.61 
 
 		 587 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  33.94 
 
 		 330 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.8 
 
 		 872 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 123 aa  53.1  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  42.86 
 
 		 546 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  35.35 
 
 		 515 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  35.35 
 
 		 519 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  36.76 
 
 		 1079 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  35.35 
 
 		 515 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  33.7 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  33.66 
 
 		 518 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  35.35 
 
 		 515 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  35.35 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  35.35 
 
 		 515 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 544 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  36.36 
 
 		 515 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  32.14 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  35.35 
 
 		 515 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 368 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  38.95 
 
 		 264 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  35.64 
 
 		 290 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  34.04 
 
 		 253 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.07 
 
 		 289 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 511 aa  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>