120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1998 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 123 aa  245  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  49.57 
 
 		 307 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  47.17 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  34.29 
 
 		 335 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  39.32 
 
 		 173 aa  77  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  33.04 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.29 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 327 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  35.79 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  37.61 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  31.82 
 
 		 304 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  38.05 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  33.98 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.59 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  32.71 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  47.46 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  29.46 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  28.44 
 
 		 267 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  33.94 
 
 		 414 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  31.03 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.81 
 
 		 391 aa  53.9  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 423 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  31.91 
 
 		 546 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.13 
 
 		 470 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  32.95 
 
 		 503 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0689  Peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 186 aa  52  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  39.81 
 
 		 303 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  32.22 
 
 		 330 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  28.44 
 
 		 277 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  36.11 
 
 		 612 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.11 
 
 		 612 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  41.86 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  32.11 
 
 		 402 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  32.08 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  31.48 
 
 		 409 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  33.03 
 
 		 297 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  34.09 
 
 		 527 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  31.43 
 
 		 284 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01740  expressed protein  29.52 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  37.65 
 
 		 337 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  42.62 
 
 		 500 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 128 aa  47.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 		 405 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  29.9 
 
 		 446 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 		 567 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  26.19 
 
 		 286 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  37 
 
 		 456 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  35.24 
 
 		 250 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  26.36 
 
 		 253 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  33.33 
 
 		 320 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  30.11 
 
 		 265 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  39.33 
 
 		 617 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1818  peptidase M23B  37.35 
 
 		 286 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  29.79 
 
 		 467 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  35.37 
 
 		 499 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  25.71 
 
 		 320 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2121  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.83 
 
 		 259 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01000  LysM-repeat domain protein  32.14 
 
 		 651 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  31.13 
 
 		 420 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  35.29 
 
 		 314 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  34.44 
 
 		 301 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  26.32 
 
 		 361 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  25.84 
 
 		 286 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0164  Peptidase M23  29.55 
 
 		 353 aa  44.7  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  24.42 
 
 		 290 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  24.73 
 
 		 324 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.31 
 
 		 1001 aa  43.9  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  27.66 
 
 		 384 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  41.86 
 
 		 203 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  30.85 
 
 		 442 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0704  peptidoglycan-binding LysM  32.94 
 
 		 411 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  31.46 
 
 		 466 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  25 
 
 		 253 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  34.48 
 
 		 271 aa  43.5  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  29.31 
 
 		 1021 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  26.4 
 
 		 283 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.21 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  25.97 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  26.21 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  34.38 
 
 		 544 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  30.84 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1994  LysM domain-containing protein  32.53 
 
 		 4132 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1285  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.78 
 
 		 376 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  25.24 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  27 
 
 		 419 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 		 797 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08466  conserved hypothetical protein  32.56 
 
 		 289 aa  41.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520763 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00543  hypothetical protein  27.34 
 
 		 545 aa  41.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  24.27 
 
 		 265 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  24.27 
 
 		 265 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  24.27 
 
 		 265 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1191  regulatory protein dnir  30.68 
 
 		 404 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  29.89 
 
 		 423 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  32.94 
 
 		 514 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  25.66 
 
 		 265 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  25.24 
 
 		 265 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  24.27 
 
 		 265 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>