More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11320 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
173 aa  350  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.29 
 
 
289 aa  154  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  46.88 
 
 
179 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  46.75 
 
 
307 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.01 
 
 
230 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
156 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.5 
 
 
327 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  41.51 
 
 
112 aa  94  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  31.02 
 
 
389 aa  93.6  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.26 
 
 
1001 aa  91.3  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  33.94 
 
 
546 aa  90.1  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  29.59 
 
 
1021 aa  89  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 
142 aa  88.6  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  33.52 
 
 
409 aa  88.6  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.19 
 
 
470 aa  87.8  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  27.67 
 
 
423 aa  87.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  29.28 
 
 
1079 aa  85.9  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  24.62 
 
 
849 aa  84  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  25.91 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  29.75 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  41.12 
 
 
301 aa  81.3  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  29.87 
 
 
620 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.33 
 
 
515 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 
405 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  30.38 
 
 
733 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.19 
 
 
274 aa  77.8  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  32.11 
 
 
402 aa  77.4  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  30.19 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  39.32 
 
 
123 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  36.07 
 
 
297 aa  75.5  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  38.83 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  27.33 
 
 
337 aa  75.1  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.7 
 
 
797 aa  75.1  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  40.78 
 
 
271 aa  74.3  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.33 
 
 
617 aa  74.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  31.19 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  38.05 
 
 
465 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.57 
 
 
568 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2378  peptidoglycan-binding LysM  26.67 
 
 
634 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  29.01 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  26.88 
 
 
498 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  39.81 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.68 
 
 
303 aa  72  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  25.26 
 
 
509 aa  71.2  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  37.61 
 
 
289 aa  71.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  39.42 
 
 
335 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  38.83 
 
 
503 aa  70.9  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  40.48 
 
 
278 aa  70.9  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  28.32 
 
 
445 aa  70.9  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  33.33 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  27.33 
 
 
544 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  28 
 
 
515 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  32.76 
 
 
384 aa  68.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  28.32 
 
 
515 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.96 
 
 
530 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  28.31 
 
 
338 aa  67.8  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  36.61 
 
 
530 aa  67.8  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  34.55 
 
 
466 aa  68.2  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  39.22 
 
 
271 aa  67.8  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  25.29 
 
 
554 aa  67.8  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  33.62 
 
 
328 aa  67.8  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  30.64 
 
 
341 aa  67.8  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  34.31 
 
 
262 aa  67  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  35.58 
 
 
368 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  35.92 
 
 
295 aa  67  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01000  LysM-repeat domain protein  28.02 
 
 
651 aa  66.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  26.74 
 
 
534 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  25.88 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  28.57 
 
 
515 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  24.86 
 
 
514 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  27.51 
 
 
698 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  28.33 
 
 
430 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  33.03 
 
 
414 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0164  Peptidase M23  35.11 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  28.57 
 
 
515 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  26.06 
 
 
495 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  33.66 
 
 
428 aa  65.1  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.02 
 
 
534 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  27.12 
 
 
511 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  36.89 
 
 
420 aa  64.3  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.99 
 
 
464 aa  64.3  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  30.25 
 
 
264 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  26.63 
 
 
518 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  25.47 
 
 
547 aa  64.3  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  24.86 
 
 
539 aa  64.3  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 
517 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  26.14 
 
 
517 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  28.34 
 
 
440 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  32.41 
 
 
467 aa  63.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  47.37 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  26.97 
 
 
519 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  27.53 
 
 
515 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.32 
 
 
679 aa  62.8  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  26.97 
 
 
515 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  23.56 
 
 
287 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  25.27 
 
 
517 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  34.31 
 
 
283 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  26.79 
 
 
539 aa  63.2  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.67 
 
 
457 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>