280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03671 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  33.97 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  32.3 
 
 
337 aa  181  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  35.15 
 
 
499 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  29.97 
 
 
286 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  29.51 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03621  LysM domain-containing protein  31.28 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.624755  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  33.02 
 
 
253 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  31 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  32.7 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.74 
 
 
470 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.57 
 
 
568 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.25 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  30.96 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  27.51 
 
 
338 aa  82  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.4 
 
 
327 aa  79  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.65 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  27.62 
 
 
612 aa  76.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.62 
 
 
612 aa  76.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  26.67 
 
 
620 aa  72.4  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  27.75 
 
 
554 aa  72.4  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.28 
 
 
576 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.68 
 
 
797 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  30.95 
 
 
428 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  38.83 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  29.89 
 
 
661 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  30.36 
 
 
596 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  32.05 
 
 
571 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  24.89 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.82 
 
 
1001 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  29.94 
 
 
487 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.94 
 
 
499 aa  66.6  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  26.19 
 
 
539 aa  66.6  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  28.07 
 
 
546 aa  66.2  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  23.68 
 
 
550 aa  65.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  32.43 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  35.05 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 
849 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.57 
 
 
534 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  24.61 
 
 
524 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  37.86 
 
 
417 aa  64.7  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  31.08 
 
 
1556 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  31.53 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  26.6 
 
 
519 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.03 
 
 
515 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  30.06 
 
 
595 aa  63.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  23.56 
 
 
173 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.33 
 
 
528 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.69 
 
 
532 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  25.83 
 
 
428 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  25.82 
 
 
514 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  25.81 
 
 
543 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.65 
 
 
679 aa  60.8  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  25.41 
 
 
517 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  33.33 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 
637 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  24.86 
 
 
547 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2378  peptidoglycan-binding LysM  32.4 
 
 
634 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 
631 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  33.64 
 
 
515 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  33.64 
 
 
515 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08381  hypothetical protein  31.94 
 
 
141 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.275743  hitchhiker  0.00161407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  29.66 
 
 
394 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  28.92 
 
 
733 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  33.64 
 
 
519 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.61 
 
 
617 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 
593 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  26.79 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  33.64 
 
 
515 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  25 
 
 
402 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  24.57 
 
 
544 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  26.67 
 
 
638 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  30.69 
 
 
517 aa  59.7  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  33.93 
 
 
283 aa  59.7  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  29.7 
 
 
511 aa  59.7  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  25.53 
 
 
539 aa  59.3  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  25.81 
 
 
515 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  28.42 
 
 
534 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  27.62 
 
 
519 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  30.39 
 
 
466 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.33 
 
 
527 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  27.64 
 
 
503 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  26.18 
 
 
1021 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  35.48 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  35.48 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  33.98 
 
 
142 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.19 
 
 
448 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  24.6 
 
 
399 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.36 
 
 
457 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.96 
 
 
530 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  31.9 
 
 
563 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  30.89 
 
 
466 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 
390 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  27.33 
 
 
1079 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1082  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.49 
 
 
400 aa  57.4  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.690054  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  25 
 
 
515 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.79 
 
 
954 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  24.74 
 
 
372 aa  57  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  33.93 
 
 
442 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  29.06 
 
 
341 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>