More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1297 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  100 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  30.15 
 
 		 509 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  26.26 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  25.83 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  23.55 
 
 		 323 aa  99  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  24.59 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  29.13 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  25.44 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  31.31 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  26.99 
 
 		 264 aa  89.4  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  26.55 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  26.07 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  28.64 
 
 		 261 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  26.3 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  26.55 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  36.28 
 
 		 423 aa  86.7  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  29.24 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  25 
 
 		 246 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  25.08 
 
 		 449 aa  85.5  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  27.35 
 
 		 244 aa  85.5  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  27.35 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  25.12 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1818  peptidase M23B  24.56 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  23.59 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  28.05 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  35.54 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.52 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  23.08 
 
 		 464 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  23.36 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  29.32 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  25.71 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  25.71 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  25.63 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  25.63 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  27.7 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  25.63 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  25.63 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  23.47 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  25.71 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  25.71 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  25.33 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  25.63 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  28.03 
 
 		 620 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  26.19 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  25.71 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  28.04 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  28.45 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  21.52 
 
 		 471 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  21.02 
 
 		 474 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  25.21 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  25.33 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  24.64 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  28.5 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  28.48 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  27.8 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  26.44 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.63 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  25.31 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  28.25 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  28.64 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  21 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  31.25 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.97 
 
 		 552 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  27.03 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  27.27 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  24.89 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  30 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  23.53 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  28.16 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  23.9 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  25.59 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  35.34 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  26.92 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  26.92 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  26.92 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  26.92 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  26.92 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  24.66 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  21.4 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  26.92 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  26.44 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  24.32 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  26.46 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  26.46 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  26.46 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  26.46 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  25.73 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  26.46 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  26.46 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  26.46 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  26.19 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  25 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  24.77 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  24.12 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  25.23 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  23.47 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>