169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2379 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
698 aa  1414    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01000  LysM-repeat domain protein  28.61 
 
 
651 aa  298  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1862  Peptidoglycan-binding LysM  26.44 
 
 
642 aa  213  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.746272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  43.95 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2378  peptidoglycan-binding LysM  31.05 
 
 
634 aa  134  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  34.98 
 
 
389 aa  94  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2150  LysM domain-containing protein  33.09 
 
 
501 aa  82  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  31.98 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  30 
 
 
514 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  26.45 
 
 
1001 aa  68.2  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.97 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  25.43 
 
 
179 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  26.74 
 
 
1021 aa  66.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  27.51 
 
 
173 aa  66.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  28.19 
 
 
547 aa  66.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.41 
 
 
517 aa  65.9  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  28.8 
 
 
638 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.38 
 
 
528 aa  63.9  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  26.17 
 
 
546 aa  63.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  25 
 
 
556 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.15 
 
 
840 aa  63.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  35.4 
 
 
467 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  28.95 
 
 
583 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  23.3 
 
 
539 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  30.81 
 
 
338 aa  62.4  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  27.59 
 
 
546 aa  61.6  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  34.51 
 
 
301 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  25.93 
 
 
393 aa  61.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.77 
 
 
289 aa  60.8  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  24.73 
 
 
534 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  26.97 
 
 
515 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  26.44 
 
 
580 aa  59.7  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  32.3 
 
 
301 aa  58.9  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  22.89 
 
 
620 aa  58.9  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  29.61 
 
 
265 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  29.61 
 
 
265 aa  58.9  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  29.61 
 
 
265 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  25.27 
 
 
499 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  29.61 
 
 
265 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  27.54 
 
 
444 aa  58.5  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  26.97 
 
 
515 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  30.77 
 
 
560 aa  58.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.22 
 
 
532 aa  58.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  23.84 
 
 
519 aa  58.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  29.21 
 
 
849 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
327 aa  58.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  24.43 
 
 
509 aa  58.2  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.3 
 
 
631 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.3 
 
 
593 aa  57.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.55 
 
 
637 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  25.42 
 
 
552 aa  57.4  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  33.33 
 
 
571 aa  57.4  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  25.63 
 
 
479 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  21.54 
 
 
554 aa  56.6  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  22.95 
 
 
515 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2121  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.76 
 
 
259 aa  57  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  25.48 
 
 
414 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  25.13 
 
 
479 aa  56.2  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  25.2 
 
 
587 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0523  hypothetical protein  23.49 
 
 
582 aa  56.6  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  26.55 
 
 
527 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  23.66 
 
 
530 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  25.15 
 
 
544 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.31 
 
 
470 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  24.06 
 
 
534 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  25.15 
 
 
511 aa  55.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  24.9 
 
 
409 aa  55.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  30.77 
 
 
271 aa  55.8  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  21.36 
 
 
555 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  25.15 
 
 
527 aa  55.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  29.82 
 
 
503 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0994  hypothetical protein  22.46 
 
 
407 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207935  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  27.6 
 
 
287 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  28.29 
 
 
265 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.81 
 
 
597 aa  53.9  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000317907  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  28.48 
 
 
595 aa  53.9  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  34.04 
 
 
650 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  31.16 
 
 
277 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  27.63 
 
 
265 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  29.75 
 
 
265 aa  53.9  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0474  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.61 
 
 
801 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  23.77 
 
 
617 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  25 
 
 
515 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.2 
 
 
377 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  29.46 
 
 
498 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.65 
 
 
576 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  28.57 
 
 
542 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  25.99 
 
 
517 aa  52.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  25.52 
 
 
518 aa  52.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  22.11 
 
 
423 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  32 
 
 
346 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  27.33 
 
 
265 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  27.63 
 
 
265 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1082  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
400 aa  52  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.690054  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.98 
 
 
679 aa  51.6  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  24.28 
 
 
524 aa  51.6  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25.39 
 
 
612 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  25.39 
 
 
612 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  24.42 
 
 
446 aa  51.2  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  27.63 
 
 
265 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>