12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0994 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0994  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  835    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0523  hypothetical protein  22.82 
 
 		 582 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0935  hypothetical protein  25.08 
 
 		 583 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0337995  normal  0.523565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6855  hypothetical protein  22.92 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01000  LysM-repeat domain protein  23.28 
 
 		 651 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2150  LysM domain-containing protein  21.54 
 
 		 501 aa  67  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1862  Peptidoglycan-binding LysM  23.08 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.746272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1149  hypothetical protein  21.01 
 
 		 567 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.658364  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  22.46 
 
 		 698 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2013  hypothetical protein  20.5 
 
 		 597 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3957  hypothetical protein  19.95 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>